RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561040.1

MEIS3-209, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,809 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-209ENST00000561040 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.89□□□□□ -1.47
MEIS3-209ENST00000561040 MT1EP04732 61 aa5.86□□□□□ -1.47
MEIS3-209ENST00000561040 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
MEIS3-209ENST00000561040 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
MEIS3-209ENST00000561040 MT1LQ93083 61 aa5.78□□□□□ -1.48
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.68□□□□□ -1.5
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.61□□□□□ -1.51
MEIS3-209ENST00000561040 MT1GP13640 62 aa5.6□□□□□ -1.51
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.58□□□□□ -1.52
MEIS3-209ENST00000561040 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.57□□□□□ -1.52
MEIS3-209ENST00000561040 NEBP20929 6669 aa5.52□□□□□ -1.53
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.51□□□□□ -1.53
MEIS3-209ENST00000561040 MT1MQ8N339 61 aa5.51□□□□□ -1.53
MEIS3-209ENST00000561040 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.5□□□□□ -1.53
MEIS3-209ENST00000561040 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.46□□□□□ -1.53
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-9P26371 169 aa5.44□□□□□ -1.54
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.39□□□□□ -1.55
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.35□□□□□ -1.55
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.35□□□□□ -1.55
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.35□□□□□ -1.55
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.34□□□□□ -1.55
MEIS3-209ENST00000561040 MDN1Q9NU22 5596 aa5.3□□□□□ -1.56
MEIS3-209ENST00000561040 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.28□□□□□ -1.56
MEIS3-209ENST00000561040 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.23□□□□□ -1.57
MEIS3-209ENST00000561040 SPRR2EP22531 72 aa5.23□□□□□ -1.57
MEIS3-209ENST00000561040 SPRR2BP35325 72 aa5.23□□□□□ -1.57
MEIS3-209ENST00000561040 SPRR2AP35326 72 aa5.23□□□□□ -1.57
MEIS3-209ENST00000561040 SPRR2DP22532 72 aa5.03□□□□□ -1.6
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5□□□□□ -1.61
MEIS3-209ENST00000561040 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
MEIS3-209ENST00000561040 MT1AP04731 61 aa4.94□□□□□ -1.62
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.86□□□□□ -1.63
MEIS3-209ENST00000561040 LCE3BQ5TA77 95 aa4.8□□□□□ -1.64
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP12-4P60329 112 aa4.74□□□□□ -1.65
MEIS3-209ENST00000561040 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.68□□□□□ -1.66
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.67□□□□□ -1.66
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.6□□□□□ -1.67
MEIS3-209ENST00000561040 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.51□□□□□ -1.69
MEIS3-209ENST00000561040 LCE4AQ5TA78 99 aa4.5□□□□□ -1.69
MEIS3-209ENST00000561040 MT3P25713 68 aa4.49□□□□□ -1.69
MEIS3-209ENST00000561040 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.48□□□□□ -1.69
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.43□□□□□ -1.7
MEIS3-209ENST00000561040 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.39□□□□□ -1.71
MEIS3-209ENST00000561040 LCE1DQ5T752 114 aa4.39□□□□□ -1.71
MEIS3-209ENST00000561040 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.35□□□□□ -1.71
MEIS3-209ENST00000561040 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.34□□□□□ -1.71
MEIS3-209ENST00000561040 MT4P47944 62 aa4.32□□□□□ -1.72
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.3□□□□□ -1.72
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.29□□□□□ -1.72
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.23□□□□□ -1.73
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.22□□□□□ -1.73
MEIS3-209ENST00000561040 PRM1P04553 51 aa4.21□□□□□ -1.74
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.11□□□□□ -1.75
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.1□□□□□ -1.75
MEIS3-209ENST00000561040 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.96□□□□□ -1.78
MEIS3-209ENST00000561040 LCE1EQ5T753 118 aa3.84□□□□□ -1.79
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.7□□□□□ -1.82
MEIS3-209ENST00000561040 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.59□□□□□ -1.83
MEIS3-209ENST00000561040 MUC5ACP98088 5654 aa3.58□□□□□ -1.84
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-8O75690 187 aa3.57□□□□□ -1.84
MEIS3-209ENST00000561040 LCE1CQ5T751 118 aa3.57□□□□□ -1.84
MEIS3-209ENST00000561040 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.57□□□□□ -1.84
MEIS3-209ENST00000561040 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.52□□□□□ -1.85
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.45□□□□□ -1.86
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.17□□□□□ -1.9
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.12□□□□□ -1.91
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.82□□□□□ -1.96
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.79□□□□□ -1.96
MEIS3-209ENST00000561040 LCE1FQ5T754 118 aa2.78□□□□□ -1.96
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.76□□□□□ -1.97
MEIS3-209ENST00000561040 PHGR1C9JFL3 82 aa2.67□□□□□ -1.98
MEIS3-209ENST00000561040 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.29□□□□□ -2.04
MEIS3-209ENST00000561040 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.75□□□□□ -2.13
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