RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560939.5

TLE3-223, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TLE3, Length 3,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-223	ENST00000560939	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TLE3-223	ENST00000560939	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
TLE3-223	ENST00000560939	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TLE3-223	ENST00000560939	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TLE3-223	ENST00000560939	MT1G	P13640	62 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TLE3-223	ENST00000560939	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TLE3-223	ENST00000560939	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TLE3-223	ENST00000560939	MT1M	Q8N339	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TLE3-223	ENST00000560939	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TLE3-223	ENST00000560939	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TLE3-223	ENST00000560939	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TLE3-223	ENST00000560939	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TLE3-223	ENST00000560939	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TLE3-223	ENST00000560939	SPRR2E	P22531	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TLE3-223	ENST00000560939	SPRR2B	P35325	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TLE3-223	ENST00000560939	SPRR2A	P35326	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TLE3-223	ENST00000560939	PRM1	P04553	51 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TLE3-223	ENST00000560939	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TLE3-223	ENST00000560939	SPRR2D	P22532	72 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
TLE3-223	ENST00000560939	MT1A	P04731	61 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TLE3-223	ENST00000560939	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TLE3-223	ENST00000560939	NEB	P20929	6669 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TLE3-223	ENST00000560939	MT4	P47944	62 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TLE3-223	ENST00000560939	MT3	P25713	68 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TLE3-223	ENST00000560939	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TLE3-223	ENST00000560939	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TLE3-223	ENST00000560939	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.84	□□□□□ -1.8
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TLE3-223	ENST00000560939	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TLE3-223	ENST00000560939	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TLE3-223	ENST00000560939	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TLE3-223	ENST00000560939	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TLE3-223	ENST00000560939	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TLE3-223	ENST00000560939	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TLE3-223	ENST00000560939	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TLE3-223	ENST00000560939	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TLE3-223	ENST00000560939	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TLE3-223	ENST00000560939	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TLE3-223	ENST00000560939	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TLE3-223	ENST00000560939	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
TLE3-223	ENST00000560939	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.53	□□□□□ -2.16

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