RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 SNURFQ9Y675 71 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-227ENST00000551441 LCE3AQ5TA76 89 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-227ENST00000551441 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-227ENST00000551441 KRTAP12-1P59990 96 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GV90 55 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-227ENST00000551441 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-227ENST00000551441 J3QR89 54 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-227ENST00000551441 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-227ENST00000551441 SEC61GP60059 68 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GU33 70 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-227ENST00000551441 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-227ENST00000551441 COA5Q86WW8 74 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CS-227ENST00000551441 TNP1P09430 55 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-227ENST00000551441 KRTAP12-4P60329 112 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-227ENST00000551441 A8MU10 97 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-227ENST00000551441 LCE1EQ5T753 118 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-227ENST00000551441 KRTAP12-3P60328 96 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-227ENST00000551441 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CS-227ENST00000551441 SVIPQ8NHG7 77 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-227ENST00000551441 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-227ENST00000551441 SERP2Q8N6R1 65 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GU69 56 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-227ENST00000551441 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CS-227ENST00000551441 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CS-227ENST00000551441 K7ERU9 68 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-8O75690 187 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-227ENST00000551441 MUC5ACP98088 5654 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-227ENST00000551441 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-227ENST00000551441 H7BZZ5 65 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-227ENST00000551441 PCP4P48539 62 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-227ENST00000551441 MT1AP04731 61 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-227ENST00000551441 COX7CP15954 63 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-227ENST00000551441 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-227ENST00000551441 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-227ENST00000551441 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-227ENST00000551441 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-227ENST00000551441 A0A0A0MQY5 61 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-227ENST00000551441 PRR15LQ9BU68 103 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-227ENST00000551441 MT3P25713 68 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-227ENST00000551441 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-227ENST00000551441 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-227ENST00000551441 UQCR11O14957 56 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-227ENST00000551441 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-227ENST00000551441 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.4□□□□□ -1.71
CS-227ENST00000551441 CCDC179H3BU77 68 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-227ENST00000551441 K7ERS5 55 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-227ENST00000551441 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
CS-227ENST00000551441 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
CS-227ENST00000551441 PSPHP1O15172 72 aa4.16□□□□□ -1.74
CS-227ENST00000551441 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-227ENST00000551441 Q1T7F1 81 aa4.1□□□□□ -1.75
CS-227ENST00000551441 TMEM258P61165 79 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-227ENST00000551441 ROMO1P60602 79 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-227ENST00000551441 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-227ENST00000551441 A6NED7 52 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-227ENST00000551441 V9GYY9 64 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-227ENST00000551441 PRAC1Q96KF2 57 aa3.9□□□□□ -1.79
CS-227ENST00000551441 LCE1FQ5T754 118 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-227ENST00000551441 LCE1CQ5T751 118 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-227ENST00000551441 NDUFAF8A1L188 74 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-227ENST00000551441 PHGR1C9JFL3 82 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-227ENST00000551441 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-227ENST00000551441 BRK1Q8WUW1 75 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-227ENST00000551441 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.33□□□□□ -1.88
CS-227ENST00000551441 PRO0628Q9UI54 55 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-227ENST00000551441 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-227ENST00000551441 PMAIP1Q13794 54 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-227ENST00000551441 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.05□□□□□ -1.92
CS-227ENST00000551441 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-227ENST00000551441 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.57□□□□□ -2
CS-227ENST00000551441 LUZP6Q538Z0 58 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-227ENST00000551441 PRM1P04553 51 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-227ENST00000551441 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.02□□□□□ -2.09
CS-227ENST00000551441 INE1O15225 51 aa1.99□□□□□ -2.09
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