RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-219ENST00000550655 PSPHP1O15172 72 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-219ENST00000550655 Q1T7F1 81 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-219ENST00000550655 V9GYY9 64 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-219ENST00000550655 KRTAP12-3P60328 96 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-219ENST00000550655 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-219ENST00000550655 K7ERS5 55 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-219ENST00000550655 LCE1DQ5T752 114 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-219ENST00000550655 LCE4AQ5TA78 99 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-219ENST00000550655 MT4P47944 62 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-219ENST00000550655 A6NED7 52 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-219ENST00000550655 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-219ENST00000550655 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-219ENST00000550655 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-219ENST00000550655 PCP4P48539 62 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CS-219ENST00000550655 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-219ENST00000550655 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-219ENST00000550655 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-219ENST00000550655 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-219ENST00000550655 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-219ENST00000550655 ROMO1P60602 79 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-219ENST00000550655 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-219ENST00000550655 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-219ENST00000550655 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-219ENST00000550655 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-219ENST00000550655 KRTAP12-4P60329 112 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-219ENST00000550655 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CS-219ENST00000550655 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-219ENST00000550655 MT1AP04731 61 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-219ENST00000550655 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-219ENST00000550655 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-219ENST00000550655 BRK1Q8WUW1 75 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-219ENST00000550655 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-8O75690 187 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-219ENST00000550655 MT3P25713 68 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-219ENST00000550655 PMAIP1Q13794 54 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-219ENST00000550655 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-219ENST00000550655 PRAC1Q96KF2 57 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-219ENST00000550655 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-219ENST00000550655 MUC5ACP98088 5654 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-219ENST00000550655 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CS-219ENST00000550655 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CS-219ENST00000550655 LCE1EQ5T753 118 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-219ENST00000550655 PRO0628Q9UI54 55 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-219ENST00000550655 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-219ENST00000550655 SVIPQ8NHG7 77 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-219ENST00000550655 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-219ENST00000550655 LCE1CQ5T751 118 aa4.18□□□□□ -1.74
CS-219ENST00000550655 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-219ENST00000550655 LUZP6Q538Z0 58 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-219ENST00000550655 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-219ENST00000550655 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.79□□□□□ -1.8
CS-219ENST00000550655 LCE1FQ5T754 118 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-219ENST00000550655 H3BS24 57 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-219ENST00000550655 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-219ENST00000550655 PHGR1C9JFL3 82 aa3.27□□□□□ -1.89
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-219ENST00000550655 A0A0A0MQY5 61 aa3.19□□□□□ -1.9
CS-219ENST00000550655 NDUFAF8A1L188 74 aa3.12□□□□□ -1.91
CS-219ENST00000550655 PRM1P04553 51 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-219ENST00000550655 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.9□□□□□ -1.95
CS-219ENST00000550655 INE1O15225 51 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-219ENST00000550655 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-219ENST00000550655 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.15□□□□□ -2.07
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