RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 PSPHP1O15172 72 aa8.72□□□□□ -1.01
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.64□□□□□ -1.03
PITX3-202ENST00000539804 MT1LQ93083 61 aa8.62□□□□□ -1.03
PITX3-202ENST00000539804 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PITX3-202ENST00000539804 MT1MQ8N339 61 aa8.55□□□□□ -1.04
PITX3-202ENST00000539804 A6NED7 52 aa8.53□□□□□ -1.04
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP12-3P60328 96 aa8.52□□□□□ -1.05
PITX3-202ENST00000539804 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.38□□□□□ -1.07
PITX3-202ENST00000539804 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.32□□□□□ -1.08
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.3□□□□□ -1.08
PITX3-202ENST00000539804 LCE4AQ5TA78 99 aa8.3□□□□□ -1.08
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.22□□□□□ -1.09
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.19□□□□□ -1.1
PITX3-202ENST00000539804 ROMO1P60602 79 aa8.14□□□□□ -1.11
PITX3-202ENST00000539804 LCE1DQ5T752 114 aa8.11□□□□□ -1.11
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.07□□□□□ -1.12
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.07□□□□□ -1.12
PITX3-202ENST00000539804 MT4P47944 62 aa8.04□□□□□ -1.12
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.04□□□□□ -1.12
PITX3-202ENST00000539804 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.87□□□□□ -1.15
PITX3-202ENST00000539804 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.85□□□□□ -1.15
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.78□□□□□ -1.16
PITX3-202ENST00000539804 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.73□□□□□ -1.17
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP12-4P60329 112 aa7.73□□□□□ -1.17
PITX3-202ENST00000539804 BRK1Q8WUW1 75 aa7.72□□□□□ -1.17
PITX3-202ENST00000539804 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.69□□□□□ -1.18
PITX3-202ENST00000539804 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.65□□□□□ -1.18
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.6□□□□□ -1.19
PITX3-202ENST00000539804 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.46□□□□□ -1.22
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.46□□□□□ -1.22
PITX3-202ENST00000539804 MT1AP04731 61 aa7.38□□□□□ -1.23
PITX3-202ENST00000539804 PRO0628Q9UI54 55 aa7.35□□□□□ -1.23
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.34□□□□□ -1.23
PITX3-202ENST00000539804 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PITX3-202ENST00000539804 PMAIP1Q13794 54 aa7.26□□□□□ -1.25
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.24□□□□□ -1.25
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.23□□□□□ -1.25
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.2□□□□□ -1.26
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.13□□□□□ -1.27
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.09□□□□□ -1.27
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.92□□□□□ -1.3
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.91□□□□□ -1.3
PITX3-202ENST00000539804 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.88□□□□□ -1.31
PITX3-202ENST00000539804 PRAC1Q96KF2 57 aa6.86□□□□□ -1.31
PITX3-202ENST00000539804 MT3P25713 68 aa6.82□□□□□ -1.32
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-8O75690 187 aa6.64□□□□□ -1.35
PITX3-202ENST00000539804 SVIPQ8NHG7 77 aa6.52□□□□□ -1.37
PITX3-202ENST00000539804 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.39□□□□□ -1.39
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.39□□□□□ -1.39
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.3□□□□□ -1.4
PITX3-202ENST00000539804 LCE1EQ5T753 118 aa6.23□□□□□ -1.41
PITX3-202ENST00000539804 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PITX3-202ENST00000539804 MUC5ACP98088 5654 aa6.11□□□□□ -1.43
PITX3-202ENST00000539804 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PITX3-202ENST00000539804 LUZP6Q538Z0 58 aa5.86□□□□□ -1.47
PITX3-202ENST00000539804 LCE1CQ5T751 118 aa5.76□□□□□ -1.49
PITX3-202ENST00000539804 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.76□□□□□ -1.49
PITX3-202ENST00000539804 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.73□□□□□ -1.49
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.73□□□□□ -1.49
PITX3-202ENST00000539804 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.43□□□□□ -1.54
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PITX3-202ENST00000539804 NDUFAF8A1L188 74 aa5.25□□□□□ -1.57
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.19□□□□□ -1.58
PITX3-202ENST00000539804 LCE1FQ5T754 118 aa5.1□□□□□ -1.59
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.07□□□□□ -1.6
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.77□□□□□ -1.65
PITX3-202ENST00000539804 A0A0A0MQY5 61 aa4.53□□□□□ -1.68
PITX3-202ENST00000539804 PHGR1C9JFL3 82 aa4.45□□□□□ -1.7
PITX3-202ENST00000539804 INE1O15225 51 aa4.33□□□□□ -1.72
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.27□□□□□ -1.73
PITX3-202ENST00000539804 PRM1P04553 51 aa4.1□□□□□ -1.75
PITX3-202ENST00000539804 H3BS24 57 aa3.95□□□□□ -1.78
PITX3-202ENST00000539804 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.92□□□□□ -1.78
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.39□□□□□ -1.87
PITX3-202ENST00000539804 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.87□□□□□ -1.95
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