RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FADS3-208	ENST00000529404	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FADS3-208	ENST00000529404	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FADS3-208	ENST00000529404	MT1G	P13640	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FADS3-208	ENST00000529404	MT1M	Q8N339	61 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FADS3-208	ENST00000529404	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FADS3-208	ENST00000529404	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FADS3-208	ENST00000529404	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FADS3-208	ENST00000529404	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FADS3-208	ENST00000529404	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FADS3-208	ENST00000529404	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FADS3-208	ENST00000529404	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FADS3-208	ENST00000529404	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FADS3-208	ENST00000529404	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FADS3-208	ENST00000529404	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FADS3-208	ENST00000529404	MT1A	P04731	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69
FADS3-208	ENST00000529404	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.47	□□□□□ -1.69
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.47	□□□□□ -1.69
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.44	□□□□□ -1.7
FADS3-208	ENST00000529404	SPRR2E	P22531	72 aa		4.42	□□□□□ -1.7
FADS3-208	ENST00000529404	SPRR2B	P35325	72 aa		4.42	□□□□□ -1.7
FADS3-208	ENST00000529404	SPRR2A	P35326	72 aa		4.42	□□□□□ -1.7
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FADS3-208	ENST00000529404	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.27	□□□□□ -1.73
FADS3-208	ENST00000529404	SPRR2D	P22532	72 aa		4.24	□□□□□ -1.73
FADS3-208	ENST00000529404	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.22	□□□□□ -1.73
FADS3-208	ENST00000529404	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FADS3-208	ENST00000529404	NEB	P20929	6669 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.02	□□□□□ -1.77
FADS3-208	ENST00000529404	MT3	P25713	68 aa		4.02	□□□□□ -1.77
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FADS3-208	ENST00000529404	PRM1	P04553	51 aa		3.94	□□□□□ -1.78
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.92	□□□□□ -1.78
FADS3-208	ENST00000529404	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.81	□□□□□ -1.8
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FADS3-208	ENST00000529404	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.7	□□□□□ -1.82
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.7	□□□□□ -1.82
FADS3-208	ENST00000529404	MT4	P47944	62 aa		3.69	□□□□□ -1.82
FADS3-208	ENST00000529404	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.68	□□□□□ -1.82
FADS3-208	ENST00000529404	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.68	□□□□□ -1.82
FADS3-208	ENST00000529404	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FADS3-208	ENST00000529404	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FADS3-208	ENST00000529404	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FADS3-208	ENST00000529404	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.27	□□□□□ -1.89
FADS3-208	ENST00000529404	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FADS3-208	ENST00000529404	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.19	□□□□□ -1.9
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.15	□□□□□ -1.9
FADS3-208	ENST00000529404	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.95	□□□□□ -1.94
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.92	□□□□□ -1.94
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.84	□□□□□ -1.95
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FADS3-208	ENST00000529404	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.61	□□□□□ -1.99
FADS3-208	ENST00000529404	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.59	□□□□□ -2
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.49	□□□□□ -2.01
FADS3-208	ENST00000529404	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.45	□□□□□ -2.02
FADS3-208	ENST00000529404	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.34	□□□□□ -2.04
FADS3-208	ENST00000529404	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.59	□□□□□ -2.15

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