RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
PUF60-213	ENST00000528999	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	MT1G	P13640	62 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	KMT2D	O14686	5537 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PUF60-213	ENST00000528999	MT1M	Q8N339	61 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PUF60-213	ENST00000528999	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PUF60-213	ENST00000528999	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PUF60-213	ENST00000528999	NEB	P20929	6669 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PUF60-213	ENST00000528999	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUF60-213	ENST00000528999	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PUF60-213	ENST00000528999	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PUF60-213	ENST00000528999	SPRR2E	P22531	72 aa		3.26	□□□□□ -1.89
PUF60-213	ENST00000528999	SPRR2B	P35325	72 aa		3.26	□□□□□ -1.89
PUF60-213	ENST00000528999	SPRR2A	P35326	72 aa		3.26	□□□□□ -1.89
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PUF60-213	ENST00000528999	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PUF60-213	ENST00000528999	MT1A	P04731	61 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PUF60-213	ENST00000528999	SPRR2D	P22532	72 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PUF60-213	ENST00000528999	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PUF60-213	ENST00000528999	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PUF60-213	ENST00000528999	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3	□□□□□ -1.93
PUF60-213	ENST00000528999	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PUF60-213	ENST00000528999	MT3	P25713	68 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PUF60-213	ENST00000528999	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PUF60-213	ENST00000528999	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PUF60-213	ENST00000528999	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PUF60-213	ENST00000528999	LCE1D	Q5T752	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUF60-213	ENST00000528999	MT4	P47944	62 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PUF60-213	ENST00000528999	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PUF60-213	ENST00000528999	PRM1	P04553	51 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.58	□□□□□ -2
PUF60-213	ENST00000528999	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.56	□□□□□ -2
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.54	□□□□□ -2
PUF60-213	ENST00000528999	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.51	□□□□□ -2.01
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.47	□□□□□ -2.01
PUF60-213	ENST00000528999	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.47	□□□□□ -2.01
PUF60-213	ENST00000528999	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PUF60-213	ENST00000528999	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PUF60-213	ENST00000528999	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.14	□□□□□ -2.07
PUF60-213	ENST00000528999	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.14	□□□□□ -2.07
PUF60-213	ENST00000528999	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.13	□□□□□ -2.07
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.06	□□□□□ -2.08
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2	□□□□□ -2.09
PUF60-213	ENST00000528999	LCE1F	Q5T754	118 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PUF60-213	ENST00000528999	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		1.72	□□□□□ -2.13
PUF60-213	ENST00000528999	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.71	□□□□□ -2.14
PUF60-213	ENST00000528999	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.44	□□□□□ -2.18
PUF60-213	ENST00000528999	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.11	□□□□□ -2.23

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