RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SPRR2EP22531 72 aa3.61□□□□□ -1.83
TRPS1-211ENST00000520276 SPRR2BP35325 72 aa3.61□□□□□ -1.83
TRPS1-211ENST00000520276 SPRR2AP35326 72 aa3.61□□□□□ -1.83
TRPS1-211ENST00000520276 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.58□□□□□ -1.84
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.57□□□□□ -1.84
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.57□□□□□ -1.84
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.57□□□□□ -1.84
TRPS1-211ENST00000520276 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-211ENST00000520276 SPRR2DP22532 72 aa3.49□□□□□ -1.85
TRPS1-211ENST00000520276 MT1EP04732 61 aa3.42□□□□□ -1.86
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-9P26371 169 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-211ENST00000520276 MT1GP13640 62 aa3.4□□□□□ -1.86
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.4□□□□□ -1.86
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.38□□□□□ -1.87
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.36□□□□□ -1.87
TRPS1-211ENST00000520276 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.35□□□□□ -1.87
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.34□□□□□ -1.87
TRPS1-211ENST00000520276 MT1LQ93083 61 aa3.33□□□□□ -1.88
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP12-4P60329 112 aa3.32□□□□□ -1.88
TRPS1-211ENST00000520276 LCE3BQ5TA77 95 aa3.29□□□□□ -1.88
TRPS1-211ENST00000520276 NEBP20929 6669 aa3.27□□□□□ -1.89
TRPS1-211ENST00000520276 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.27□□□□□ -1.89
TRPS1-211ENST00000520276 MT1MQ8N339 61 aa3.26□□□□□ -1.89
TRPS1-211ENST00000520276 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.24□□□□□ -1.89
TRPS1-211ENST00000520276 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.23□□□□□ -1.89
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.21□□□□□ -1.9
TRPS1-211ENST00000520276 MDN1Q9NU22 5596 aa3.2□□□□□ -1.9
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.16□□□□□ -1.9
TRPS1-211ENST00000520276 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.09□□□□□ -1.91
TRPS1-211ENST00000520276 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRPS1-211ENST00000520276 MT4P47944 62 aa3.05□□□□□ -1.92
TRPS1-211ENST00000520276 PRM1P04553 51 aa3.01□□□□□ -1.93
TRPS1-211ENST00000520276 LCE4AQ5TA78 99 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TRPS1-211ENST00000520276 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.89□□□□□ -1.95
TRPS1-211ENST00000520276 MT1AP04731 61 aa2.88□□□□□ -1.95
TRPS1-211ENST00000520276 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.88□□□□□ -1.95
TRPS1-211ENST00000520276 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.86□□□□□ -1.95
TRPS1-211ENST00000520276 LCE1DQ5T752 114 aa2.86□□□□□ -1.95
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.79□□□□□ -1.96
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.78□□□□□ -1.96
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.77□□□□□ -1.97
TRPS1-211ENST00000520276 MT3P25713 68 aa2.76□□□□□ -1.97
TRPS1-211ENST00000520276 LCE1EQ5T753 118 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.74□□□□□ -1.97
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.73□□□□□ -1.97
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.72□□□□□ -1.97
TRPS1-211ENST00000520276 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.67□□□□□ -1.98
TRPS1-211ENST00000520276 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.61□□□□□ -1.99
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.52□□□□□ -2.01
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.46□□□□□ -2.02
TRPS1-211ENST00000520276 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.43□□□□□ -2.02
TRPS1-211ENST00000520276 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.42□□□□□ -2.02
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.42□□□□□ -2.02
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.36□□□□□ -2.03
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.35□□□□□ -2.03
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.25□□□□□ -2.05
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-8O75690 187 aa2.25□□□□□ -2.05
TRPS1-211ENST00000520276 LCE1FQ5T754 118 aa2.24□□□□□ -2.05
TRPS1-211ENST00000520276 MUC5ACP98088 5654 aa2.19□□□□□ -2.06
TRPS1-211ENST00000520276 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.18□□□□□ -2.06
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.14□□□□□ -2.07
TRPS1-211ENST00000520276 LCE1CQ5T751 118 aa2.07□□□□□ -2.08
TRPS1-211ENST00000520276 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.03□□□□□ -2.08
TRPS1-211ENST00000520276 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.97□□□□□ -2.09
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.88□□□□□ -2.11
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.84□□□□□ -2.11
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.77□□□□□ -2.13
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.75□□□□□ -2.13
TRPS1-211ENST00000520276 PHGR1C9JFL3 82 aa1.59□□□□□ -2.16
TRPS1-211ENST00000520276 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.02□□□□□ -2.25
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