RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPS1-208ENST00000519076 LCE3BQ5TA77 95 aa2.72□□□□□ -1.97
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.72□□□□□ -1.97
TRPS1-208ENST00000519076 MT1EP04732 61 aa2.71□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.71□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.71□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.71□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 MT1LQ93083 61 aa2.69□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.69□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.65□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.65□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 LCE4AQ5TA78 99 aa2.64□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 LCE1DQ5T752 114 aa2.63□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.62□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.62□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.62□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 MT1GP13640 62 aa2.61□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.6□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.59□□□□□ -1.99
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.59□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.58□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.58□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 MT1MQ8N339 61 aa2.57□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP12-4P60329 112 aa2.55□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 SPRR2EP22531 72 aa2.54□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 SPRR2BP35325 72 aa2.54□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 SPRR2AP35326 72 aa2.54□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.53□□□□□ -2
TRPS1-208ENST00000519076 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.47□□□□□ -2.01
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.46□□□□□ -2.02
TRPS1-208ENST00000519076 LCE1EQ5T753 118 aa2.46□□□□□ -2.02
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.46□□□□□ -2.02
TRPS1-208ENST00000519076 MDN1Q9NU22 5596 aa2.46□□□□□ -2.02
TRPS1-208ENST00000519076 SPRR2DP22532 72 aa2.43□□□□□ -2.02
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.43□□□□□ -2.02
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-9P26371 169 aa2.36□□□□□ -2.03
TRPS1-208ENST00000519076 PRM1P04553 51 aa2.32□□□□□ -2.04
TRPS1-208ENST00000519076 LCE1FQ5T754 118 aa2.32□□□□□ -2.04
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.3□□□□□ -2.04
TRPS1-208ENST00000519076 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.28□□□□□ -2.04
TRPS1-208ENST00000519076 MT1AP04731 61 aa2.27□□□□□ -2.05
TRPS1-208ENST00000519076 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.22□□□□□ -2.05
TRPS1-208ENST00000519076 MT4P47944 62 aa2.19□□□□□ -2.06
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
TRPS1-208ENST00000519076 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.16□□□□□ -2.06
TRPS1-208ENST00000519076 MT3P25713 68 aa2.14□□□□□ -2.07
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.14□□□□□ -2.07
TRPS1-208ENST00000519076 NEBP20929 6669 aa2.13□□□□□ -2.07
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.03□□□□□ -2.08
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.96□□□□□ -2.1
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.96□□□□□ -2.1
TRPS1-208ENST00000519076 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.93□□□□□ -2.1
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
TRPS1-208ENST00000519076 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.88□□□□□ -2.11
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.78□□□□□ -2.12
TRPS1-208ENST00000519076 MUC5ACP98088 5654 aa1.74□□□□□ -2.13
TRPS1-208ENST00000519076 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.69□□□□□ -2.14
TRPS1-208ENST00000519076 LCE1CQ5T751 118 aa1.64□□□□□ -2.15
TRPS1-208ENST00000519076 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
TRPS1-208ENST00000519076 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.58□□□□□ -2.16
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.57□□□□□ -2.16
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.56□□□□□ -2.16
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.55□□□□□ -2.16
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-8O75690 187 aa1.54□□□□□ -2.16
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.5□□□□□ -2.17
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.49□□□□□ -2.17
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.41□□□□□ -2.18
TRPS1-208ENST00000519076 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.38□□□□□ -2.19
TRPS1-208ENST00000519076 PHGR1C9JFL3 82 aa1.17□□□□□ -2.22
TRPS1-208ENST00000519076 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.75□□□□□ -2.29
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