RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 PSPHP1O15172 72 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP12-3P60328 96 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 Q1T7F1 81 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 V9GYY9 64 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE1DQ5T752 114 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 K7ERS5 55 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MT4P47944 62 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE4AQ5TA78 99 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 A6NED7 52 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PCP4P48539 62 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 ROMO1P60602 79 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP12-4P60329 112 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MT1AP04731 61 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 BRK1Q8WUW1 75 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-8O75690 187 aa5.21□□□□□ -1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 MT3P25713 68 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PMAIP1Q13794 54 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAC1Q96KF2 57 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PRO0628Q9UI54 55 aa4.98□□□□□ -1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC5ACP98088 5654 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE1EQ5T753 118 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SVIPQ8NHG7 77 aa4.51□□□□□ -1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.51□□□□□ -1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.46□□□□□ -1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE1CQ5T751 118 aa4.35□□□□□ -1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 LUZP6Q538Z0 58 aa4.06□□□□□ -1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.06□□□□□ -1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.97□□□□□ -1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE1FQ5T754 118 aa3.77□□□□□ -1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFAF8A1L188 74 aa3.54□□□□□ -1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.45□□□□□ -1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 PHGR1C9JFL3 82 aa3.43□□□□□ -1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 PRM1P04553 51 aa3.14□□□□□ -1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.13□□□□□ -1.91
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0A0MQY5 61 aa3.05□□□□□ -1.92
SH3BP2-218ENST00000511185 INE1O15225 51 aa2.94□□□□□ -1.94
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.53□□□□□ -2
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BS24 57 aa2.26□□□□□ -2.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.23□□□□□ -2.05
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