RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE1EQ5T753 118 aa3.9□□□□□ -1.78
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.9□□□□□ -1.79
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
SH3BP2-217ENST00000510204 SSPOA2VEC9 5147 aa3.84□□□□□ -1.79
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP2-217ENST00000510204 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SH3BP2-217ENST00000510204 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.79□□□□□ -1.8
SH3BP2-217ENST00000510204 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP2-217ENST00000510204 MT1LQ93083 61 aa3.77□□□□□ -1.81
SH3BP2-217ENST00000510204 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.77□□□□□ -1.81
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE1DQ5T752 114 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP2-217ENST00000510204 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
SH3BP2-217ENST00000510204 MT1EP04732 61 aa3.72□□□□□ -1.81
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.72□□□□□ -1.81
SH3BP2-217ENST00000510204 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SH3BP2-217ENST00000510204 PRM1P04553 51 aa3.69□□□□□ -1.82
SH3BP2-217ENST00000510204 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.69□□□□□ -1.82
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.65□□□□□ -1.82
SH3BP2-217ENST00000510204 MT1GP13640 62 aa3.64□□□□□ -1.83
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE1FQ5T754 118 aa3.55□□□□□ -1.84
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.55□□□□□ -1.84
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MT1MQ8N339 61 aa3.5□□□□□ -1.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.49□□□□□ -1.85
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.49□□□□□ -1.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.48□□□□□ -1.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.45□□□□□ -1.86
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE3BQ5TA77 95 aa3.43□□□□□ -1.86
SH3BP2-217ENST00000510204 MT1AP04731 61 aa3.4□□□□□ -1.87
SH3BP2-217ENST00000510204 MDN1Q9NU22 5596 aa3.38□□□□□ -1.87
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.26□□□□□ -1.89
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.23□□□□□ -1.89
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRR2EP22531 72 aa3.19□□□□□ -1.9
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRR2BP35325 72 aa3.19□□□□□ -1.9
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRR2AP35326 72 aa3.19□□□□□ -1.9
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-9P26371 169 aa3.16□□□□□ -1.9
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRR2DP22532 72 aa3.04□□□□□ -1.92
SH3BP2-217ENST00000510204 NEBP20929 6669 aa2.99□□□□□ -1.93
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.94□□□□□ -1.94
SH3BP2-217ENST00000510204 MT3P25713 68 aa2.86□□□□□ -1.95
SH3BP2-217ENST00000510204 MT4P47944 62 aa2.8□□□□□ -1.96
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.79□□□□□ -1.96
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.73□□□□□ -1.97
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.72□□□□□ -1.97
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.67□□□□□ -1.98
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.61□□□□□ -1.99
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE1CQ5T751 118 aa2.59□□□□□ -2
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.59□□□□□ -2
SH3BP2-217ENST00000510204 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.56□□□□□ -2
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.54□□□□□ -2
SH3BP2-217ENST00000510204 LCE4AQ5TA78 99 aa2.53□□□□□ -2
SH3BP2-217ENST00000510204 MUC5ACP98088 5654 aa2.44□□□□□ -2.02
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.38□□□□□ -2.03
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.37□□□□□ -2.03
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.36□□□□□ -2.03
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.35□□□□□ -2.03
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.3□□□□□ -2.04
SH3BP2-217ENST00000510204 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.3□□□□□ -2.04
SH3BP2-217ENST00000510204 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.3□□□□□ -2.04
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.25□□□□□ -2.05
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.14□□□□□ -2.07
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.11□□□□□ -2.07
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-8O75690 187 aa2.07□□□□□ -2.08
SH3BP2-217ENST00000510204 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.09
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.02□□□□□ -2.09
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.99□□□□□ -2.09
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
SH3BP2-217ENST00000510204 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.76□□□□□ -2.13
SH3BP2-217ENST00000510204 PHGR1C9JFL3 82 aa1.55□□□□□ -2.16
SH3BP2-217ENST00000510204 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.22□□□□□ -2.21
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