RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 PSPHP1O15172 72 aa6.92□□□□□ -1.3
C1orf61-220ENST00000489918 Q1T7F1 81 aa6.87□□□□□ -1.31
C1orf61-220ENST00000489918 V9GYY9 64 aa6.87□□□□□ -1.31
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.85□□□□□ -1.31
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.83□□□□□ -1.32
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP12-3P60328 96 aa6.82□□□□□ -1.32
C1orf61-220ENST00000489918 K7ERS5 55 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.72□□□□□ -1.33
C1orf61-220ENST00000489918 LCE1DQ5T752 114 aa6.67□□□□□ -1.34
C1orf61-220ENST00000489918 A6NED7 52 aa6.65□□□□□ -1.34
C1orf61-220ENST00000489918 LCE4AQ5TA78 99 aa6.65□□□□□ -1.34
C1orf61-220ENST00000489918 MT4P47944 62 aa6.61□□□□□ -1.35
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.57□□□□□ -1.36
C1orf61-220ENST00000489918 PCP4P48539 62 aa6.56□□□□□ -1.36
C1orf61-220ENST00000489918 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
C1orf61-220ENST00000489918 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.53□□□□□ -1.36
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf61-220ENST00000489918 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf61-220ENST00000489918 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.42□□□□□ -1.38
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.39□□□□□ -1.39
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
C1orf61-220ENST00000489918 ROMO1P60602 79 aa6.37□□□□□ -1.39
C1orf61-220ENST00000489918 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.36□□□□□ -1.39
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.35□□□□□ -1.39
C1orf61-220ENST00000489918 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.29□□□□□ -1.4
C1orf61-220ENST00000489918 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.25□□□□□ -1.41
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.2□□□□□ -1.42
C1orf61-220ENST00000489918 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.15□□□□□ -1.42
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.15□□□□□ -1.42
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP12-4P60329 112 aa6.14□□□□□ -1.43
C1orf61-220ENST00000489918 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.03□□□□□ -1.44
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.99□□□□□ -1.45
C1orf61-220ENST00000489918 MT1AP04731 61 aa5.95□□□□□ -1.46
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.95□□□□□ -1.46
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.87□□□□□ -1.47
C1orf61-220ENST00000489918 BRK1Q8WUW1 75 aa5.79□□□□□ -1.48
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.78□□□□□ -1.48
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.74□□□□□ -1.49
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.65□□□□□ -1.5
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.63□□□□□ -1.51
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-8O75690 187 aa5.46□□□□□ -1.54
C1orf61-220ENST00000489918 MT3P25713 68 aa5.42□□□□□ -1.54
C1orf61-220ENST00000489918 PMAIP1Q13794 54 aa5.42□□□□□ -1.54
C1orf61-220ENST00000489918 PRAC1Q96KF2 57 aa5.29□□□□□ -1.56
C1orf61-220ENST00000489918 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.27□□□□□ -1.57
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.17□□□□□ -1.58
C1orf61-220ENST00000489918 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.12□□□□□ -1.59
C1orf61-220ENST00000489918 MUC5ACP98088 5654 aa5.08□□□□□ -1.6
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C1orf61-220ENST00000489918 PRO0628Q9UI54 55 aa5.03□□□□□ -1.6
C1orf61-220ENST00000489918 H3BS24 57 aa4.95□□□□□ -1.62
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C1orf61-220ENST00000489918 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.82□□□□□ -1.64
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.72□□□□□ -1.65
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C1orf61-220ENST00000489918 SVIPQ8NHG7 77 aa4.64□□□□□ -1.67
C1orf61-220ENST00000489918 LCE1CQ5T751 118 aa4.6□□□□□ -1.67
C1orf61-220ENST00000489918 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.53□□□□□ -1.68
C1orf61-220ENST00000489918 LUZP6Q538Z0 58 aa4.36□□□□□ -1.71
C1orf61-220ENST00000489918 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.28□□□□□ -1.72
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.26□□□□□ -1.73
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.17□□□□□ -1.74
C1orf61-220ENST00000489918 LCE1FQ5T754 118 aa3.99□□□□□ -1.77
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.92□□□□□ -1.78
C1orf61-220ENST00000489918 A0A0A0MQY5 61 aa3.72□□□□□ -1.81
C1orf61-220ENST00000489918 PHGR1C9JFL3 82 aa3.6□□□□□ -1.83
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.6□□□□□ -1.83
C1orf61-220ENST00000489918 NDUFAF8A1L188 74 aa3.57□□□□□ -1.84
C1orf61-220ENST00000489918 PRM1P04553 51 aa3.29□□□□□ -1.88
C1orf61-220ENST00000489918 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.25□□□□□ -1.89
C1orf61-220ENST00000489918 INE1O15225 51 aa2.8□□□□□ -1.96
C1orf61-220ENST00000489918 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.68□□□□□ -1.98
C1orf61-220ENST00000489918 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.36□□□□□ -2.03
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