RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 PSPHP1O15172 72 aa8.69□□□□□ -1.02
EHD1-211ENST00000489379 MT1LQ93083 61 aa8.68□□□□□ -1.02
EHD1-211ENST00000489379 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EHD1-211ENST00000489379 MT1MQ8N339 61 aa8.6□□□□□ -1.03
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.59□□□□□ -1.03
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP12-3P60328 96 aa8.52□□□□□ -1.05
EHD1-211ENST00000489379 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EHD1-211ENST00000489379 A6NED7 52 aa8.45□□□□□ -1.06
EHD1-211ENST00000489379 PCP4P48539 62 aa8.38□□□□□ -1.07
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.33□□□□□ -1.08
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.31□□□□□ -1.08
EHD1-211ENST00000489379 LCE4AQ5TA78 99 aa8.3□□□□□ -1.08
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.3□□□□□ -1.08
EHD1-211ENST00000489379 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.23□□□□□ -1.09
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.22□□□□□ -1.09
EHD1-211ENST00000489379 LCE1DQ5T752 114 aa8.17□□□□□ -1.1
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.17□□□□□ -1.1
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.14□□□□□ -1.11
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EHD1-211ENST00000489379 ROMO1P60602 79 aa8.08□□□□□ -1.12
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EHD1-211ENST00000489379 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.74□□□□□ -1.17
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EHD1-211ENST00000489379 KRTAP12-4P60329 112 aa7.7□□□□□ -1.18
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EHD1-211ENST00000489379 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.96□□□□□ -1.3
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EHD1-211ENST00000489379 KRTAP5-8O75690 187 aa6.7□□□□□ -1.34
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EHD1-211ENST00000489379 PRAC1Q96KF2 57 aa6.59□□□□□ -1.35
EHD1-211ENST00000489379 SVIPQ8NHG7 77 aa6.58□□□□□ -1.36
EHD1-211ENST00000489379 PRO0628Q9UI54 55 aa6.55□□□□□ -1.36
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EHD1-211ENST00000489379 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.37□□□□□ -1.39
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EHD1-211ENST00000489379 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.24□□□□□ -1.41
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EHD1-211ENST00000489379 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.41□□□□□ -1.54
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.2□□□□□ -1.58
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.14□□□□□ -1.59
EHD1-211ENST00000489379 LCE1FQ5T754 118 aa5.07□□□□□ -1.6
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EHD1-211ENST00000489379 NDUFAF8A1L188 74 aa4.58□□□□□ -1.68
EHD1-211ENST00000489379 H3BS24 57 aa4.5□□□□□ -1.69
EHD1-211ENST00000489379 PHGR1C9JFL3 82 aa4.47□□□□□ -1.69
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.33□□□□□ -1.72
EHD1-211ENST00000489379 PRM1P04553 51 aa4.1□□□□□ -1.75
EHD1-211ENST00000489379 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.04□□□□□ -1.76
EHD1-211ENST00000489379 A0A0A0MQY5 61 aa3.87□□□□□ -1.79
EHD1-211ENST00000489379 INE1O15225 51 aa3.78□□□□□ -1.8
EHD1-211ENST00000489379 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.36□□□□□ -1.87
EHD1-211ENST00000489379 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.89□□□□□ -1.95
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