RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476787.1

PQLC3-208, Transcript of PQ loop repeat containing 3, human

TSL 3

Gene PQLC3, Length 469 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.8	□□□□□ -1.32
PQLC3-208	ENST00000476787	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.71	□□□□□ -1.34
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PQLC3-208	ENST00000476787		V9GYY9	64 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PQLC3-208	ENST00000476787		K7ERS5	55 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PQLC3-208	ENST00000476787	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PQLC3-208	ENST00000476787	PSPHP1	O15172	72 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PQLC3-208	ENST00000476787	MT4	P47944	62 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PQLC3-208	ENST00000476787		Q1T7F1	81 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.41	□□□□□ -1.38
PQLC3-208	ENST00000476787		A6NED7	52 aa		6.4	□□□□□ -1.38
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.39	□□□□□ -1.39
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.39	□□□□□ -1.39
PQLC3-208	ENST00000476787	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PQLC3-208	ENST00000476787	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PQLC3-208	ENST00000476787	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PQLC3-208	ENST00000476787	PCP4	P48539	62 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PQLC3-208	ENST00000476787	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PQLC3-208	ENST00000476787	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PQLC3-208	ENST00000476787	ROMO1	P60602	79 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PQLC3-208	ENST00000476787	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PQLC3-208	ENST00000476787	MT1A	P04731	61 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PQLC3-208	ENST00000476787	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PQLC3-208	ENST00000476787	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PQLC3-208	ENST00000476787	MT3	P25713	68 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PQLC3-208	ENST00000476787	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PQLC3-208	ENST00000476787	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PQLC3-208	ENST00000476787	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PQLC3-208	ENST00000476787	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PQLC3-208	ENST00000476787	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PQLC3-208	ENST00000476787	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PQLC3-208	ENST00000476787	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PQLC3-208	ENST00000476787	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PQLC3-208	ENST00000476787	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PQLC3-208	ENST00000476787	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PQLC3-208	ENST00000476787	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PQLC3-208	ENST00000476787	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PQLC3-208	ENST00000476787	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PQLC3-208	ENST00000476787		H3BS24	57 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PQLC3-208	ENST00000476787	PRM1	P04553	51 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PQLC3-208	ENST00000476787		A0A0A0MQY5	61 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PQLC3-208	ENST00000476787	INE1	O15225	51 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PQLC3-208	ENST00000476787	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PQLC3-208	ENST00000476787	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.33	□□□□□ -2.04

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