RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460132.5

PLOD3-208, Transcript of procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, human

TSL 3

Gene PLOD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLOD3-208	ENST00000460132	MT1L	Q93083	61 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PLOD3-208	ENST00000460132	TMEM258	P61165	79 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PLOD3-208	ENST00000460132	MT1M	Q8N339	61 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PLOD3-208	ENST00000460132	UQCR11	O14957	56 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PLOD3-208	ENST00000460132	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PLOD3-208	ENST00000460132	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PLOD3-208	ENST00000460132	MT4	P47944	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PLOD3-208	ENST00000460132	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PLOD3-208	ENST00000460132		V9GYY9	64 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PLOD3-208	ENST00000460132	PSPHP1	O15172	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PLOD3-208	ENST00000460132		K7ERS5	55 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLOD3-208	ENST00000460132		Q1T7F1	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLOD3-208	ENST00000460132	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PLOD3-208	ENST00000460132	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PLOD3-208	ENST00000460132		A6NED7	52 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PLOD3-208	ENST00000460132	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PLOD3-208	ENST00000460132	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PLOD3-208	ENST00000460132	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLOD3-208	ENST00000460132	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PLOD3-208	ENST00000460132	ROMO1	P60602	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PLOD3-208	ENST00000460132	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLOD3-208	ENST00000460132	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PLOD3-208	ENST00000460132	MT1A	P04731	61 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PLOD3-208	ENST00000460132	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.33	□□□□□ -1.72
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.29	□□□□□ -1.72
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PLOD3-208	ENST00000460132	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PLOD3-208	ENST00000460132	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PLOD3-208	ENST00000460132	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PLOD3-208	ENST00000460132	MT3	P25713	68 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PLOD3-208	ENST00000460132	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4	□□□□□ -1.77
PLOD3-208	ENST00000460132	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
PLOD3-208	ENST00000460132	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
PLOD3-208	ENST00000460132	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.93	□□□□□ -1.78
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PLOD3-208	ENST00000460132	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PLOD3-208	ENST00000460132	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PLOD3-208	ENST00000460132	INE1	O15225	51 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PLOD3-208	ENST00000460132	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PLOD3-208	ENST00000460132	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.51	□□□□□ -2.01
PLOD3-208	ENST00000460132	PRM1	P04553	51 aa		2.35	□□□□□ -2.03
PLOD3-208	ENST00000460132	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.06	□□□□□ -2.08
PLOD3-208	ENST00000460132	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.77	□□□□□ -2.13

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