RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 K7ERS5 55 aa6.48□□□□□ -1.37
CXorf40A-210ENST00000448332 V9GYY9 64 aa6.45□□□□□ -1.38
CXorf40A-210ENST00000448332 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.45□□□□□ -1.38
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.43□□□□□ -1.38
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP12-3P60328 96 aa6.39□□□□□ -1.39
CXorf40A-210ENST00000448332 PSPHP1O15172 72 aa6.38□□□□□ -1.39
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.35□□□□□ -1.39
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE4AQ5TA78 99 aa6.32□□□□□ -1.4
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.32□□□□□ -1.4
CXorf40A-210ENST00000448332 Q1T7F1 81 aa6.31□□□□□ -1.4
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE1DQ5T752 114 aa6.3□□□□□ -1.4
CXorf40A-210ENST00000448332 MT4P47944 62 aa6.27□□□□□ -1.41
CXorf40A-210ENST00000448332 A6NED7 52 aa6.22□□□□□ -1.41
CXorf40A-210ENST00000448332 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.21□□□□□ -1.42
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.18□□□□□ -1.42
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.13□□□□□ -1.43
CXorf40A-210ENST00000448332 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.08□□□□□ -1.44
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.06□□□□□ -1.44
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.02□□□□□ -1.45
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.02□□□□□ -1.45
CXorf40A-210ENST00000448332 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.97□□□□□ -1.45
CXorf40A-210ENST00000448332 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.97□□□□□ -1.45
CXorf40A-210ENST00000448332 ROMO1P60602 79 aa5.94□□□□□ -1.46
CXorf40A-210ENST00000448332 PCP4P48539 62 aa5.92□□□□□ -1.46
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.89□□□□□ -1.47
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP12-4P60329 112 aa5.87□□□□□ -1.47
CXorf40A-210ENST00000448332 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.86□□□□□ -1.47
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.86□□□□□ -1.47
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.83□□□□□ -1.48
CXorf40A-210ENST00000448332 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.82□□□□□ -1.48
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.71□□□□□ -1.5
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.7□□□□□ -1.5
CXorf40A-210ENST00000448332 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CXorf40A-210ENST00000448332 MT1AP04731 61 aa5.57□□□□□ -1.52
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.51□□□□□ -1.53
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.45□□□□□ -1.54
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.38□□□□□ -1.55
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.36□□□□□ -1.55
CXorf40A-210ENST00000448332 BRK1Q8WUW1 75 aa5.34□□□□□ -1.55
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.32□□□□□ -1.56
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.29□□□□□ -1.56
CXorf40A-210ENST00000448332 SVIPQ8NHG7 77 aa5.26□□□□□ -1.57
CXorf40A-210ENST00000448332 MT3P25713 68 aa5.12□□□□□ -1.59
CXorf40A-210ENST00000448332 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.1□□□□□ -1.59
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-8O75690 187 aa5.1□□□□□ -1.59
CXorf40A-210ENST00000448332 PMAIP1Q13794 54 aa5□□□□□ -1.61
CXorf40A-210ENST00000448332 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.93□□□□□ -1.62
CXorf40A-210ENST00000448332 MUC5ACP98088 5654 aa4.92□□□□□ -1.62
CXorf40A-210ENST00000448332 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.81□□□□□ -1.64
CXorf40A-210ENST00000448332 PRAC1Q96KF2 57 aa4.79□□□□□ -1.64
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE1EQ5T753 118 aa4.66□□□□□ -1.66
CXorf40A-210ENST00000448332 PRO0628Q9UI54 55 aa4.59□□□□□ -1.67
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.45□□□□□ -1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.42□□□□□ -1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.36□□□□□ -1.71
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE1CQ5T751 118 aa4.32□□□□□ -1.72
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.25□□□□□ -1.73
CXorf40A-210ENST00000448332 LUZP6Q538Z0 58 aa4.17□□□□□ -1.74
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.01□□□□□ -1.77
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.98□□□□□ -1.77
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.92□□□□□ -1.78
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
CXorf40A-210ENST00000448332 LCE1FQ5T754 118 aa3.81□□□□□ -1.8
CXorf40A-210ENST00000448332 H3BS24 57 aa3.7□□□□□ -1.82
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.6□□□□□ -1.83
CXorf40A-210ENST00000448332 PHGR1C9JFL3 82 aa3.46□□□□□ -1.86
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.33□□□□□ -1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 NDUFAF8A1L188 74 aa3.3□□□□□ -1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.14□□□□□ -1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 A0A0A0MQY5 61 aa3.12□□□□□ -1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 PRM1P04553 51 aa3.03□□□□□ -1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 INE1O15225 51 aa2.82□□□□□ -1.96
CXorf40A-210ENST00000448332 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.61□□□□□ -1.99
CXorf40A-210ENST00000448332 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.23□□□□□ -2.05
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