RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.75□□□□□ -1.33
TTLL3-210ENST00000427220 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TTLL3-210ENST00000427220 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TTLL3-210ENST00000427220 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-210ENST00000427220 MT1GP13640 62 aa6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-210ENST00000427220 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.59□□□□□ -1.35
TTLL3-210ENST00000427220 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.57□□□□□ -1.36
TTLL3-210ENST00000427220 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TTLL3-210ENST00000427220 INE1O15225 51 aa6.5□□□□□ -1.37
TTLL3-210ENST00000427220 MDN1Q9NU22 5596 aa6.46□□□□□ -1.37
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.4□□□□□ -1.38
TTLL3-210ENST00000427220 MT1MQ8N339 61 aa6.4□□□□□ -1.38
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.31□□□□□ -1.4
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.31□□□□□ -1.4
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.31□□□□□ -1.4
TTLL3-210ENST00000427220 LCE3BQ5TA77 95 aa6.2□□□□□ -1.42
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.18□□□□□ -1.42
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.12□□□□□ -1.43
TTLL3-210ENST00000427220 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.1□□□□□ -1.43
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.06□□□□□ -1.44
TTLL3-210ENST00000427220 SPRR2EP22531 72 aa5.97□□□□□ -1.45
TTLL3-210ENST00000427220 SPRR2BP35325 72 aa5.97□□□□□ -1.45
TTLL3-210ENST00000427220 SPRR2AP35326 72 aa5.97□□□□□ -1.45
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP12-4P60329 112 aa5.96□□□□□ -1.46
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.89□□□□□ -1.47
TTLL3-210ENST00000427220 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.87□□□□□ -1.47
TTLL3-210ENST00000427220 SPRR2DP22532 72 aa5.68□□□□□ -1.5
TTLL3-210ENST00000427220 MT1AP04731 61 aa5.61□□□□□ -1.51
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-9P26371 169 aa5.59□□□□□ -1.51
TTLL3-210ENST00000427220 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.56□□□□□ -1.52
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.42□□□□□ -1.54
TTLL3-210ENST00000427220 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.42□□□□□ -1.54
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.37□□□□□ -1.55
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.32□□□□□ -1.56
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.31□□□□□ -1.56
TTLL3-210ENST00000427220 PRM1P04553 51 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL3-210ENST00000427220 MT4P47944 62 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL3-210ENST00000427220 NEBP20929 6669 aa5.14□□□□□ -1.59
TTLL3-210ENST00000427220 MT3P25713 68 aa5.14□□□□□ -1.59
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.12□□□□□ -1.59
TTLL3-210ENST00000427220 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.89□□□□□ -1.63
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.75□□□□□ -1.65
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.73□□□□□ -1.65
TTLL3-210ENST00000427220 LCE1DQ5T752 114 aa4.72□□□□□ -1.65
TTLL3-210ENST00000427220 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.61□□□□□ -1.67
TTLL3-210ENST00000427220 LCE4AQ5TA78 99 aa4.56□□□□□ -1.68
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.54□□□□□ -1.68
TTLL3-210ENST00000427220 MUC5ACP98088 5654 aa4.48□□□□□ -1.69
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.44□□□□□ -1.7
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.38□□□□□ -1.71
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.34□□□□□ -1.71
TTLL3-210ENST00000427220 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.16□□□□□ -1.74
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.13□□□□□ -1.75
TTLL3-210ENST00000427220 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4□□□□□ -1.77
TTLL3-210ENST00000427220 LCE1EQ5T753 118 aa3.99□□□□□ -1.77
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.95□□□□□ -1.78
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.92□□□□□ -1.78
TTLL3-210ENST00000427220 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.9□□□□□ -1.79
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.88□□□□□ -1.79
TTLL3-210ENST00000427220 LCE1CQ5T751 118 aa3.78□□□□□ -1.8
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.74□□□□□ -1.81
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-8O75690 187 aa3.71□□□□□ -1.82
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.65□□□□□ -1.83
TTLL3-210ENST00000427220 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.59□□□□□ -1.83
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.31□□□□□ -1.88
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.27□□□□□ -1.89
TTLL3-210ENST00000427220 LCE1FQ5T754 118 aa3.25□□□□□ -1.89
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.23□□□□□ -1.89
TTLL3-210ENST00000427220 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.95□□□□□ -1.94
TTLL3-210ENST00000427220 PHGR1C9JFL3 82 aa2.85□□□□□ -1.95
TTLL3-210ENST00000427220 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.89□□□□□ -2.11
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