RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.16□□□□□ -1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC61GP60059 68 aa5.13□□□□□ -1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.13□□□□□ -1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GU33 70 aa5.07□□□□□ -1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.02□□□□□ -1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.99□□□□□ -1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.97□□□□□ -1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.96□□□□□ -1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.95□□□□□ -1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.94□□□□□ -1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1AP04731 61 aa4.92□□□□□ -1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.91□□□□□ -1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNURFQ9Y675 71 aa4.9□□□□□ -1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COA5Q86WW8 74 aa4.87□□□□□ -1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.85□□□□□ -1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A8MU10 97 aa4.84□□□□□ -1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.84□□□□□ -1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.78□□□□□ -1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 J3QR89 54 aa4.74□□□□□ -1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.73□□□□□ -1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERP2Q8N6R1 65 aa4.73□□□□□ -1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.71□□□□□ -1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.69□□□□□ -1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GU69 56 aa4.67□□□□□ -1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.62□□□□□ -1.67
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT3P25713 68 aa4.56□□□□□ -1.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GV90 55 aa4.43□□□□□ -1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR15LQ9BU68 103 aa4.42□□□□□ -1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.41□□□□□ -1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.39□□□□□ -1.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE1EQ5T753 118 aa4.37□□□□□ -1.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H7BZZ5 65 aa4.35□□□□□ -1.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7ERU9 68 aa4.19□□□□□ -1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UQCR11O14957 56 aa4.17□□□□□ -1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX7CP15954 63 aa4.14□□□□□ -1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.14□□□□□ -1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.13□□□□□ -1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7ERS5 55 aa4.11□□□□□ -1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.09□□□□□ -1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE1CQ5T751 118 aa4.05□□□□□ -1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.99□□□□□ -1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.99□□□□□ -1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.84□□□□□ -1.79
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE1FQ5T754 118 aa3.81□□□□□ -1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHGR1C9JFL3 82 aa3.77□□□□□ -1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.76□□□□□ -1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q1T7F1 81 aa3.67□□□□□ -1.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROMO1P60602 79 aa3.64□□□□□ -1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.59□□□□□ -1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC179H3BU77 68 aa3.51□□□□□ -1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSPHP1O15172 72 aa3.47□□□□□ -1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 V9GYY9 64 aa3.41□□□□□ -1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM258P61165 79 aa3.39□□□□□ -1.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A6NED7 52 aa3.34□□□□□ -1.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.27□□□□□ -1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BS24 57 aa3.26□□□□□ -1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.25□□□□□ -1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.11□□□□□ -1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.06□□□□□ -1.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.95□□□□□ -1.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SVIPQ8NHG7 77 aa2.93□□□□□ -1.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.9□□□□□ -1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCP4P48539 62 aa2.53□□□□□ -2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0A0MQY5 61 aa2.47□□□□□ -2.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRK1Q8WUW1 75 aa2.18□□□□□ -2.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.15□□□□□ -2.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAC1Q96KF2 57 aa2.03□□□□□ -2.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFAF8A1L188 74 aa1.85□□□□□ -2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LUZP6Q538Z0 58 aa1.85□□□□□ -2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMAIP1Q13794 54 aa1.82□□□□□ -2.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRM1P04553 51 aa1.79□□□□□ -2.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRO0628Q9UI54 55 aa1.22□□□□□ -2.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.11□□□□□ -2.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INE1O15225 51 aa0.6□□□□□ -2.31
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