RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394285.3

PDCL-202, Transcript of phosducin like, humanhuman

TSL 3

Gene PDCL, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-202ENST00000394285 K7ERS5 55 aa3.93□□□□□ -1.78
PDCL-202ENST00000394285 MT1LQ93083 61 aa3.92□□□□□ -1.78
PDCL-202ENST00000394285 PSPHP1O15172 72 aa3.91□□□□□ -1.78
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.89□□□□□ -1.79
PDCL-202ENST00000394285 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PDCL-202ENST00000394285 MT1MQ8N339 61 aa3.88□□□□□ -1.79
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP12-3P60328 96 aa3.85□□□□□ -1.79
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.8□□□□□ -1.8
PDCL-202ENST00000394285 A6NED7 52 aa3.8□□□□□ -1.8
PDCL-202ENST00000394285 PCP4P48539 62 aa3.8□□□□□ -1.8
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.78□□□□□ -1.8
PDCL-202ENST00000394285 LCE4AQ5TA78 99 aa3.75□□□□□ -1.81
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.74□□□□□ -1.81
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.73□□□□□ -1.81
PDCL-202ENST00000394285 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.71□□□□□ -1.82
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.7□□□□□ -1.82
PDCL-202ENST00000394285 LCE1DQ5T752 114 aa3.68□□□□□ -1.82
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.68□□□□□ -1.82
PDCL-202ENST00000394285 ROMO1P60602 79 aa3.65□□□□□ -1.83
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.64□□□□□ -1.83
PDCL-202ENST00000394285 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.63□□□□□ -1.83
PDCL-202ENST00000394285 MT4P47944 62 aa3.62□□□□□ -1.83
PDCL-202ENST00000394285 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.59□□□□□ -1.84
PDCL-202ENST00000394285 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.55□□□□□ -1.84
PDCL-202ENST00000394285 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.5□□□□□ -1.85
PDCL-202ENST00000394285 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.48□□□□□ -1.85
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP12-4P60329 112 aa3.48□□□□□ -1.85
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.45□□□□□ -1.86
PDCL-202ENST00000394285 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.45□□□□□ -1.86
PDCL-202ENST00000394285 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.39□□□□□ -1.87
PDCL-202ENST00000394285 SVIPQ8NHG7 77 aa3.37□□□□□ -1.87
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.36□□□□□ -1.87
PDCL-202ENST00000394285 MT1AP04731 61 aa3.35□□□□□ -1.87
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.32□□□□□ -1.88
PDCL-202ENST00000394285 BRK1Q8WUW1 75 aa3.31□□□□□ -1.88
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.29□□□□□ -1.88
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.27□□□□□ -1.89
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.25□□□□□ -1.89
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.24□□□□□ -1.89
PDCL-202ENST00000394285 PMAIP1Q13794 54 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL-202ENST00000394285 MT3P25713 68 aa3.08□□□□□ -1.92
PDCL-202ENST00000394285 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.07□□□□□ -1.92
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-8O75690 187 aa3.03□□□□□ -1.92
PDCL-202ENST00000394285 PRO0628Q9UI54 55 aa2.98□□□□□ -1.93
PDCL-202ENST00000394285 PRAC1Q96KF2 57 aa2.96□□□□□ -1.94
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.88□□□□□ -1.95
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.87□□□□□ -1.95
PDCL-202ENST00000394285 MUC5ACP98088 5654 aa2.87□□□□□ -1.95
PDCL-202ENST00000394285 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PDCL-202ENST00000394285 H3BS24 57 aa2.85□□□□□ -1.95
PDCL-202ENST00000394285 LCE1EQ5T753 118 aa2.85□□□□□ -1.95
PDCL-202ENST00000394285 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PDCL-202ENST00000394285 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.82□□□□□ -1.96
PDCL-202ENST00000394285 LCE1CQ5T751 118 aa2.63□□□□□ -1.99
PDCL-202ENST00000394285 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.63□□□□□ -1.99
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.62□□□□□ -1.99
PDCL-202ENST00000394285 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.59□□□□□ -1.99
PDCL-202ENST00000394285 LUZP6Q538Z0 58 aa2.58□□□□□ -2
PDCL-202ENST00000394285 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.45□□□□□ -2.02
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.36□□□□□ -2.03
PDCL-202ENST00000394285 LCE1FQ5T754 118 aa2.32□□□□□ -2.04
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.3□□□□□ -2.04
PDCL-202ENST00000394285 A0A0A0MQY5 61 aa2.25□□□□□ -2.05
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.19□□□□□ -2.06
PDCL-202ENST00000394285 NDUFAF8A1L188 74 aa2.06□□□□□ -2.08
PDCL-202ENST00000394285 PHGR1C9JFL3 82 aa2.03□□□□□ -2.08
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.93□□□□□ -2.1
PDCL-202ENST00000394285 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.85□□□□□ -2.11
PDCL-202ENST00000394285 PRM1P04553 51 aa1.84□□□□□ -2.11
PDCL-202ENST00000394285 INE1O15225 51 aa1.81□□□□□ -2.12
PDCL-202ENST00000394285 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.54□□□□□ -2.16
PDCL-202ENST00000394285 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.36□□□□□ -2.19
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