RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.8□□□□□ -1
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HOXD13-201ENST00000392539 MT1GP13640 62 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD13-201ENST00000392539 MT1MQ8N339 61 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD13-201ENST00000392539 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.53□□□□□ -1.04
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HOXD13-201ENST00000392539 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.72□□□□□ -1.17
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HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.35□□□□□ -1.39
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HOXD13-201ENST00000392539 MT4P47944 62 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.27□□□□□ -1.4
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.27□□□□□ -1.4
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.98□□□□□ -1.45
HOXD13-201ENST00000392539 LCE1DQ5T752 114 aa5.95□□□□□ -1.46
HOXD13-201ENST00000392539 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.94□□□□□ -1.46
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HOXD13-201ENST00000392539 LCE1CQ5T751 118 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXD13-201ENST00000392539 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.38□□□□□ -1.55
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HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.24□□□□□ -1.57
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HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP5-8O75690 187 aa4.95□□□□□ -1.62
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.95□□□□□ -1.62
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD13-201ENST00000392539 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.27□□□□□ -1.73
HOXD13-201ENST00000392539 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
HOXD13-201ENST00000392539 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.05□□□□□ -1.76
HOXD13-201ENST00000392539 PHGR1C9JFL3 82 aa3.99□□□□□ -1.77
HOXD13-201ENST00000392539 LCE1FQ5T754 118 aa3.83□□□□□ -1.8
HOXD13-201ENST00000392539 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.7□□□□□ -1.98
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