RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381558.6

TNNT3-204, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT3, Length 1,258 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.69□□□□□ -1.5
TNNT3-204ENST00000381558 LCE4AQ5TA78 99 aa5.62□□□□□ -1.51
TNNT3-204ENST00000381558 V9GYY9 64 aa5.62□□□□□ -1.51
TNNT3-204ENST00000381558 Q1T7F1 81 aa5.61□□□□□ -1.51
TNNT3-204ENST00000381558 PSPHP1O15172 72 aa5.6□□□□□ -1.51
TNNT3-204ENST00000381558 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
TNNT3-204ENST00000381558 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.6□□□□□ -1.51
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP12-3P60328 96 aa5.59□□□□□ -1.51
TNNT3-204ENST00000381558 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.58□□□□□ -1.52
TNNT3-204ENST00000381558 LCE1DQ5T752 114 aa5.58□□□□□ -1.52
TNNT3-204ENST00000381558 K7ERS5 55 aa5.56□□□□□ -1.52
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.56□□□□□ -1.52
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.54□□□□□ -1.52
TNNT3-204ENST00000381558 MT4P47944 62 aa5.51□□□□□ -1.53
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.49□□□□□ -1.53
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.43□□□□□ -1.54
TNNT3-204ENST00000381558 A6NED7 52 aa5.42□□□□□ -1.54
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.39□□□□□ -1.55
TNNT3-204ENST00000381558 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.37□□□□□ -1.55
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.36□□□□□ -1.55
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.35□□□□□ -1.55
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.34□□□□□ -1.55
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.28□□□□□ -1.56
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
TNNT3-204ENST00000381558 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.23□□□□□ -1.57
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.22□□□□□ -1.57
TNNT3-204ENST00000381558 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.19□□□□□ -1.58
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP12-4P60329 112 aa5.18□□□□□ -1.58
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.18□□□□□ -1.58
TNNT3-204ENST00000381558 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.15□□□□□ -1.59
TNNT3-204ENST00000381558 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.15□□□□□ -1.59
TNNT3-204ENST00000381558 ROMO1P60602 79 aa5.13□□□□□ -1.59
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.09□□□□□ -1.59
TNNT3-204ENST00000381558 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TNNT3-204ENST00000381558 BRK1Q8WUW1 75 aa5.04□□□□□ -1.6
TNNT3-204ENST00000381558 MT1AP04731 61 aa4.92□□□□□ -1.62
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.86□□□□□ -1.63
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.81□□□□□ -1.64
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.8□□□□□ -1.64
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.75□□□□□ -1.65
TNNT3-204ENST00000381558 PMAIP1Q13794 54 aa4.73□□□□□ -1.65
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.73□□□□□ -1.65
TNNT3-204ENST00000381558 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
TNNT3-204ENST00000381558 PRO0628Q9UI54 55 aa4.66□□□□□ -1.66
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.65□□□□□ -1.67
TNNT3-204ENST00000381558 MUC5ACP98088 5654 aa4.6□□□□□ -1.67
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-8O75690 187 aa4.56□□□□□ -1.68
TNNT3-204ENST00000381558 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TNNT3-204ENST00000381558 PRAC1Q96KF2 57 aa4.53□□□□□ -1.68
TNNT3-204ENST00000381558 MT3P25713 68 aa4.52□□□□□ -1.69
TNNT3-204ENST00000381558 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.52□□□□□ -1.69
TNNT3-204ENST00000381558 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.39□□□□□ -1.71
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.35□□□□□ -1.71
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.3□□□□□ -1.72
TNNT3-204ENST00000381558 SVIPQ8NHG7 77 aa4.22□□□□□ -1.73
TNNT3-204ENST00000381558 LCE1EQ5T753 118 aa4.17□□□□□ -1.74
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.89□□□□□ -1.79
TNNT3-204ENST00000381558 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.87□□□□□ -1.79
TNNT3-204ENST00000381558 LCE1CQ5T751 118 aa3.85□□□□□ -1.79
TNNT3-204ENST00000381558 LUZP6Q538Z0 58 aa3.72□□□□□ -1.81
TNNT3-204ENST00000381558 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.72□□□□□ -1.81
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TNNT3-204ENST00000381558 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.5□□□□□ -1.85
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.49□□□□□ -1.85
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.49□□□□□ -1.85
TNNT3-204ENST00000381558 LCE1FQ5T754 118 aa3.42□□□□□ -1.86
TNNT3-204ENST00000381558 NDUFAF8A1L188 74 aa3.35□□□□□ -1.87
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.21□□□□□ -1.9
TNNT3-204ENST00000381558 PHGR1C9JFL3 82 aa3.16□□□□□ -1.9
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.9□□□□□ -1.95
TNNT3-204ENST00000381558 A0A0A0MQY5 61 aa2.79□□□□□ -1.96
TNNT3-204ENST00000381558 H3BS24 57 aa2.79□□□□□ -1.96
TNNT3-204ENST00000381558 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.79□□□□□ -1.96
TNNT3-204ENST00000381558 INE1O15225 51 aa2.7□□□□□ -1.98
TNNT3-204ENST00000381558 PRM1P04553 51 aa2.61□□□□□ -1.99
TNNT3-204ENST00000381558 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.44□□□□□ -2.02
TNNT3-204ENST00000381558 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.3 ms