RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR2DP22532 72 aa3.37□□□□□ -1.87
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.37□□□□□ -1.87
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.33□□□□□ -1.88
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.31□□□□□ -1.88
TTPAL-202ENST00000372904 LCE3BQ5TA77 95 aa3.3□□□□□ -1.88
TTPAL-202ENST00000372904 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.28□□□□□ -1.88
TTPAL-202ENST00000372904 MT1MQ8N339 61 aa3.28□□□□□ -1.88
TTPAL-202ENST00000372904 USH2AO75445 5202 aa3.23□□□□□ -1.89
TTPAL-202ENST00000372904 KMT2DO14686 5537 aa3.21□□□□□ -1.9
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.18□□□□□ -1.9
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TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP12-4P60329 112 aa3.08□□□□□ -1.92
TTPAL-202ENST00000372904 SSPOA2VEC9 5147 aa3.05□□□□□ -1.92
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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TTPAL-202ENST00000372904 MT4P47944 62 aa3.01□□□□□ -1.93
TTPAL-202ENST00000372904 LCE1AQ5T7P2 110 aa3□□□□□ -1.93
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3□□□□□ -1.93
TTPAL-202ENST00000372904 LCE3DQ9BYE3 92 aa3□□□□□ -1.93
TTPAL-202ENST00000372904 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
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TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.97□□□□□ -1.93
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.97□□□□□ -1.93
TTPAL-202ENST00000372904 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
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TTPAL-202ENST00000372904 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.92□□□□□ -1.94
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TTPAL-202ENST00000372904 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.65□□□□□ -1.99
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TTPAL-202ENST00000372904 MDN1Q9NU22 5596 aa2.52□□□□□ -2.01
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.47□□□□□ -2.01
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TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.35□□□□□ -2.03
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TTPAL-202ENST00000372904 LCE1CQ5T751 118 aa2.17□□□□□ -2.06
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TTPAL-202ENST00000372904 LCE1FQ5T754 118 aa2.17□□□□□ -2.06
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.16□□□□□ -2.06
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TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.07□□□□□ -2.08
TTPAL-202ENST00000372904 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.06□□□□□ -2.08
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TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.01□□□□□ -2.09
TTPAL-202ENST00000372904 MUC5ACP98088 5654 aa1.91□□□□□ -2.1
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-8O75690 187 aa1.9□□□□□ -2.11
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.82□□□□□ -2.12
TTPAL-202ENST00000372904 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.81□□□□□ -2.12
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.8□□□□□ -2.12
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.67□□□□□ -2.14
TTPAL-202ENST00000372904 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
TTPAL-202ENST00000372904 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.64□□□□□ -2.15
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.64□□□□□ -2.15
TTPAL-202ENST00000372904 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.56□□□□□ -2.16
TTPAL-202ENST00000372904 PHGR1C9JFL3 82 aa1.43□□□□□ -2.18
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.32□□□□□ -2.2
TTPAL-202ENST00000372904 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.99□□□□□ -2.25
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