RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-205ENST00000368213 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-205ENST00000368213 MT1EP04732 61 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-205ENST00000368213 MUC17Q685J3 4493 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-205ENST00000368213 MT1LQ93083 61 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-205ENST00000368213 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRK-205ENST00000368213 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRK-205ENST00000368213 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-205ENST00000368213 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-205ENST00000368213 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-205ENST00000368213 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-205ENST00000368213 USH2AO75445 5202 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRK-205ENST00000368213 MT1AP04731 61 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-205ENST00000368213 LCE4AQ5TA78 99 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRK-205ENST00000368213 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRK-205ENST00000368213 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.96□□□□□ -1.94
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PTPRK-205ENST00000368213 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-9P26371 169 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-205ENST00000368213 MDN1Q9NU22 5596 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.7□□□□□ -1.98
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PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.41□□□□□ -2.02
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PTPRK-205ENST00000368213 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRK-205ENST00000368213 MUC5ACP98088 5654 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRK-205ENST00000368213 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRK-205ENST00000368213 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-8O75690 187 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRK-205ENST00000368213 PHGR1C9JFL3 82 aa1.87□□□□□ -2.11
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.85□□□□□ -2.11
PTPRK-205ENST00000368213 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
PTPRK-205ENST00000368213 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.13
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.65□□□□□ -2.15
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.62□□□□□ -2.15
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.49□□□□□ -2.17
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRK-205ENST00000368213 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.05□□□□□ -2.24
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