RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.64□□□□□ -1.51
GDE1-201ENST00000353258 MT1LQ93083 61 aa5.62□□□□□ -1.51
GDE1-201ENST00000353258 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
GDE1-201ENST00000353258 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.53□□□□□ -1.52
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.5□□□□□ -1.53
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP12-4P60329 112 aa5.45□□□□□ -1.54
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.43□□□□□ -1.54
GDE1-201ENST00000353258 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
GDE1-201ENST00000353258 MT1GP13640 62 aa5.31□□□□□ -1.56
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.29□□□□□ -1.56
GDE1-201ENST00000353258 MT1MQ8N339 61 aa5.28□□□□□ -1.56
GDE1-201ENST00000353258 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.28□□□□□ -1.56
GDE1-201ENST00000353258 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
GDE1-201ENST00000353258 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.24□□□□□ -1.57
GDE1-201ENST00000353258 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
GDE1-201ENST00000353258 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.12□□□□□ -1.59
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.06□□□□□ -1.6
GDE1-201ENST00000353258 MDN1Q9NU22 5596 aa5.05□□□□□ -1.6
GDE1-201ENST00000353258 LCE3BQ5TA77 95 aa5.04□□□□□ -1.6
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.01□□□□□ -1.61
GDE1-201ENST00000353258 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.92□□□□□ -1.62
GDE1-201ENST00000353258 PRM1P04553 51 aa4.9□□□□□ -1.63
GDE1-201ENST00000353258 MT1AP04731 61 aa4.88□□□□□ -1.63
GDE1-201ENST00000353258 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.86□□□□□ -1.63
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
GDE1-201ENST00000353258 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.85□□□□□ -1.63
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.84□□□□□ -1.63
GDE1-201ENST00000353258 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.83□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.82□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-9P26371 169 aa4.8□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.8□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 SPRR2EP22531 72 aa4.79□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 SPRR2BP35325 72 aa4.79□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 SPRR2AP35326 72 aa4.79□□□□□ -1.64
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.64□□□□□ -1.67
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.64□□□□□ -1.67
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.62□□□□□ -1.67
GDE1-201ENST00000353258 LCE1DQ5T752 114 aa4.61□□□□□ -1.67
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.59□□□□□ -1.68
GDE1-201ENST00000353258 SPRR2DP22532 72 aa4.57□□□□□ -1.68
GDE1-201ENST00000353258 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.55□□□□□ -1.68
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.38□□□□□ -1.71
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.38□□□□□ -1.71
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.26□□□□□ -1.73
GDE1-201ENST00000353258 MT3P25713 68 aa4.23□□□□□ -1.73
GDE1-201ENST00000353258 NEBP20929 6669 aa4.21□□□□□ -1.74
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.14□□□□□ -1.75
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.12□□□□□ -1.75
GDE1-201ENST00000353258 MT4P47944 62 aa4.1□□□□□ -1.75
GDE1-201ENST00000353258 LCE1EQ5T753 118 aa4.08□□□□□ -1.76
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.93□□□□□ -1.78
GDE1-201ENST00000353258 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.9□□□□□ -1.78
GDE1-201ENST00000353258 LCE4AQ5TA78 99 aa3.88□□□□□ -1.79
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.82□□□□□ -1.8
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.69□□□□□ -1.82
GDE1-201ENST00000353258 MUC5ACP98088 5654 aa3.66□□□□□ -1.82
GDE1-201ENST00000353258 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.54□□□□□ -1.84
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.48□□□□□ -1.85
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.32□□□□□ -1.88
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
GDE1-201ENST00000353258 LCE1CQ5T751 118 aa3.25□□□□□ -1.89
GDE1-201ENST00000353258 LCE1FQ5T754 118 aa3.15□□□□□ -1.9
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-8O75690 187 aa3.12□□□□□ -1.91
GDE1-201ENST00000353258 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.12□□□□□ -1.91
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.09□□□□□ -1.91
GDE1-201ENST00000353258 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.07□□□□□ -1.92
GDE1-201ENST00000353258 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.05□□□□□ -1.92
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.97□□□□□ -1.93
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.81□□□□□ -1.96
GDE1-201ENST00000353258 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.71□□□□□ -1.98
GDE1-201ENST00000353258 PHGR1C9JFL3 82 aa2.44□□□□□ -2.02
GDE1-201ENST00000353258 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
GDE1-201ENST00000353258 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.6□□□□□ -2.15
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