RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.24□□□□□ -2.05
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.24□□□□□ -2.05
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.24□□□□□ -2.05
CCR6-201ENST00000341935 LCE4AQ5TA78 99 aa2.23□□□□□ -2.05
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.22□□□□□ -2.05
CCR6-201ENST00000341935 LCE1DQ5T752 114 aa2.22□□□□□ -2.05
CCR6-201ENST00000341935 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCR6-201ENST00000341935 MT1EP04732 61 aa2.19□□□□□ -2.06
CCR6-201ENST00000341935 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.16□□□□□ -2.06
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-9P26371 169 aa2.15□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 MT1LQ93083 61 aa2.14□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.13□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 LCE1EQ5T753 118 aa2.12□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.12□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.12□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.11□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.11□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.11□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.1□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.1□□□□□ -2.07
CCR6-201ENST00000341935 MT1GP13640 62 aa2.08□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.07□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 SPRR2EP22531 72 aa2.07□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 SPRR2BP35325 72 aa2.07□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 SPRR2AP35326 72 aa2.07□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 LCE1FQ5T754 118 aa2.07□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 MT1MQ8N339 61 aa2.07□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.06□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 MDN1Q9NU22 5596 aa2.04□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.03□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.03□□□□□ -2.08
CCR6-201ENST00000341935 SPRR2DP22532 72 aa2□□□□□ -2.09
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.99□□□□□ -2.09
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP12-4P60329 112 aa1.99□□□□□ -2.09
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.99□□□□□ -2.09
CCR6-201ENST00000341935 NEBP20929 6669 aa1.96□□□□□ -2.1
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
CCR6-201ENST00000341935 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.94□□□□□ -2.1
CCR6-201ENST00000341935 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.87□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.87□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.87□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.86□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.84□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.84□□□□□ -2.11
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.84□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 MT3P25713 68 aa1.83□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 PRM1P04553 51 aa1.82□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 MT1AP04731 61 aa1.82□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.81□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.81□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.79□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.79□□□□□ -2.12
CCR6-201ENST00000341935 MT4P47944 62 aa1.73□□□□□ -2.13
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.69□□□□□ -2.14
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.68□□□□□ -2.14
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.67□□□□□ -2.14
CCR6-201ENST00000341935 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.65□□□□□ -2.15
CCR6-201ENST00000341935 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.6□□□□□ -2.15
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.51□□□□□ -2.17
CCR6-201ENST00000341935 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.5□□□□□ -2.17
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.47□□□□□ -2.17
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-8O75690 187 aa1.41□□□□□ -2.18
CCR6-201ENST00000341935 LCE1CQ5T751 118 aa1.38□□□□□ -2.19
CCR6-201ENST00000341935 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.38□□□□□ -2.19
CCR6-201ENST00000341935 MUC5ACP98088 5654 aa1.34□□□□□ -2.2
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.33□□□□□ -2.2
CCR6-201ENST00000341935 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.18□□□□□ -2.22
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.14□□□□□ -2.23
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.09□□□□□ -2.23
CCR6-201ENST00000341935 PHGR1C9JFL3 82 aa1.02□□□□□ -2.25
CCR6-201ENST00000341935 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.88□□□□□ -2.27
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