RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSPHP1O15172 72 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q1T7F1 81 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP12-3P60328 96 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7ERS5 55 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCP4P48539 62 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 A6NED7 52 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE4AQ5TA78 99 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE1DQ5T752 114 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT4P47944 62 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROMO1P60602 79 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP12-4P60329 112 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6□□□□□ -1.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT1AP04731 61 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRK1Q8WUW1 75 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-8O75690 187 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMAIP1Q13794 54 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT3P25713 68 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRO0628Q9UI54 55 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAC1Q96KF2 57 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC5ACP98088 5654 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE1EQ5T753 118 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SVIPQ8NHG7 77 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE1CQ5T751 118 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 LUZP6Q538Z0 58 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCE1FQ5T754 118 aa4□□□□□ -1.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFAF8A1L188 74 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHGR1C9JFL3 82 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRM1P04553 51 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0A0MQY5 61 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 INE1O15225 51 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BS24 57 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.35□□□□□ -2.03
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