RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304863.5

UQCRFS1-201, Transcript of ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UQCRFS1, Length 3,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1-201ENST00000304863 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.59□□□□□ -1.67
UQCRFS1-201ENST00000304863 MT1EP04732 61 aa4.58□□□□□ -1.68
UQCRFS1-201ENST00000304863 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
UQCRFS1-201ENST00000304863 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
UQCRFS1-201ENST00000304863 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
UQCRFS1-201ENST00000304863 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.51□□□□□ -1.69
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.48□□□□□ -1.69
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.48□□□□□ -1.69
UQCRFS1-201ENST00000304863 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP12-4P60329 112 aa4.45□□□□□ -1.7
UQCRFS1-201ENST00000304863 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.45□□□□□ -1.7
UQCRFS1-201ENST00000304863 MT1GP13640 62 aa4.43□□□□□ -1.7
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.34□□□□□ -1.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 MDN1Q9NU22 5596 aa4.27□□□□□ -1.73
UQCRFS1-201ENST00000304863 MT1MQ8N339 61 aa4.27□□□□□ -1.73
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.23□□□□□ -1.73
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.23□□□□□ -1.73
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE3BQ5TA77 95 aa4.2□□□□□ -1.74
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.19□□□□□ -1.74
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.18□□□□□ -1.74
UQCRFS1-201ENST00000304863 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.13□□□□□ -1.75
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.11□□□□□ -1.75
UQCRFS1-201ENST00000304863 PRM1P04553 51 aa4.05□□□□□ -1.76
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.02□□□□□ -1.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.02□□□□□ -1.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE1EQ5T753 118 aa4.01□□□□□ -1.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4□□□□□ -1.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.97□□□□□ -1.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.97□□□□□ -1.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.96□□□□□ -1.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 MT1AP04731 61 aa3.94□□□□□ -1.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.92□□□□□ -1.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE1DQ5T752 114 aa3.78□□□□□ -1.8
UQCRFS1-201ENST00000304863 SPRR2EP22531 72 aa3.77□□□□□ -1.81
UQCRFS1-201ENST00000304863 SPRR2BP35325 72 aa3.77□□□□□ -1.81
UQCRFS1-201ENST00000304863 SPRR2AP35326 72 aa3.77□□□□□ -1.81
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.71□□□□□ -1.82
UQCRFS1-201ENST00000304863 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.62□□□□□ -1.83
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.6□□□□□ -1.83
UQCRFS1-201ENST00000304863 SPRR2DP22532 72 aa3.57□□□□□ -1.84
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE1FQ5T754 118 aa3.47□□□□□ -1.85
UQCRFS1-201ENST00000304863 MT3P25713 68 aa3.46□□□□□ -1.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-9P26371 169 aa3.46□□□□□ -1.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 MT4P47944 62 aa3.45□□□□□ -1.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 NEBP20929 6669 aa3.44□□□□□ -1.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.34□□□□□ -1.87
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE4AQ5TA78 99 aa3.25□□□□□ -1.89
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.24□□□□□ -1.89
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.2□□□□□ -1.9
UQCRFS1-201ENST00000304863 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.17□□□□□ -1.9
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.07□□□□□ -1.92
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.05□□□□□ -1.92
UQCRFS1-201ENST00000304863 MUC5ACP98088 5654 aa3.05□□□□□ -1.92
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.94□□□□□ -1.94
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.91□□□□□ -1.94
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.9□□□□□ -1.95
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.83□□□□□ -1.96
UQCRFS1-201ENST00000304863 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.78□□□□□ -1.96
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.74□□□□□ -1.97
UQCRFS1-201ENST00000304863 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.7□□□□□ -1.98
UQCRFS1-201ENST00000304863 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.69□□□□□ -1.98
UQCRFS1-201ENST00000304863 LCE1CQ5T751 118 aa2.65□□□□□ -1.99
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.6□□□□□ -1.99
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.53□□□□□ -2
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.51□□□□□ -2.01
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.49□□□□□ -2.01
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.47□□□□□ -2.01
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.41□□□□□ -2.02
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-8O75690 187 aa2.37□□□□□ -2.03
UQCRFS1-201ENST00000304863 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.15□□□□□ -2.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 PHGR1C9JFL3 82 aa1.89□□□□□ -2.11
UQCRFS1-201ENST00000304863 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms