RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.87□□□□□ -1.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1GP13640 62 aa4.87□□□□□ -1.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1LQ93083 61 aa4.83□□□□□ -1.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 SSPOA2VEC9 5147 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1EP04732 61 aa4.74□□□□□ -1.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE3BQ5TA77 95 aa4.72□□□□□ -1.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.7□□□□□ -1.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.61□□□□□ -1.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRM1P04553 51 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1MQ8N339 61 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.4□□□□□ -1.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.38□□□□□ -1.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.37□□□□□ -1.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 MDN1Q9NU22 5596 aa4.37□□□□□ -1.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.33□□□□□ -1.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.21□□□□□ -1.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR2EP22531 72 aa4.19□□□□□ -1.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR2BP35325 72 aa4.19□□□□□ -1.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR2AP35326 72 aa4.19□□□□□ -1.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.09□□□□□ -1.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1AP04731 61 aa4.06□□□□□ -1.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.04□□□□□ -1.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR2DP22532 72 aa3.98□□□□□ -1.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.97□□□□□ -1.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.95□□□□□ -1.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.94□□□□□ -1.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.82□□□□□ -1.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT4P47944 62 aa3.8□□□□□ -1.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE1EQ5T753 118 aa3.76□□□□□ -1.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.71□□□□□ -1.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT3P25713 68 aa3.68□□□□□ -1.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.62□□□□□ -1.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE1DQ5T752 114 aa3.54□□□□□ -1.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEBP20929 6669 aa3.54□□□□□ -1.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-9P26371 169 aa3.5□□□□□ -1.85
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.43□□□□□ -1.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.41□□□□□ -1.86
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.33□□□□□ -1.88
CCNDBP1-201ENST00000300213 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.26□□□□□ -1.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.24□□□□□ -1.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC5ACP98088 5654 aa3.22□□□□□ -1.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.07□□□□□ -1.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE4AQ5TA78 99 aa3.01□□□□□ -1.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.93□□□□□ -1.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.92□□□□□ -1.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE1FQ5T754 118 aa2.88□□□□□ -1.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.87□□□□□ -1.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.86□□□□□ -1.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.79□□□□□ -1.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.72□□□□□ -1.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.72□□□□□ -1.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.7□□□□□ -1.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.7□□□□□ -1.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.61□□□□□ -1.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.6□□□□□ -1.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE1CQ5T751 118 aa2.54□□□□□ -2
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.52□□□□□ -2.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.51□□□□□ -2.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-8O75690 187 aa2.49□□□□□ -2.01
CCNDBP1-201ENST00000300213 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.05□□□□□ -2.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.03□□□□□ -2.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHGR1C9JFL3 82 aa1.82□□□□□ -2.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.32□□□□□ -2.2
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