RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.17□□□□□ -1.58
USP43-201ENST00000285199 MT1LQ93083 61 aa5.17□□□□□ -1.58
USP43-201ENST00000285199 MT1EP04732 61 aa5.09□□□□□ -1.59
USP43-201ENST00000285199 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.06□□□□□ -1.6
USP43-201ENST00000285199 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
USP43-201ENST00000285199 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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USP43-201ENST00000285199 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.94□□□□□ -1.62
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USP43-201ENST00000285199 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.91□□□□□ -1.62
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USP43-201ENST00000285199 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.84□□□□□ -1.64
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USP43-201ENST00000285199 PRM1P04553 51 aa4.78□□□□□ -1.64
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USP43-201ENST00000285199 SPRR2DP22532 72 aa4.54□□□□□ -1.68
USP43-201ENST00000285199 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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USP43-201ENST00000285199 MT1AP04731 61 aa4.36□□□□□ -1.71
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USP43-201ENST00000285199 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.29□□□□□ -1.72
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USP43-201ENST00000285199 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.9□□□□□ -1.78
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-9P26371 169 aa3.79□□□□□ -1.8
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USP43-201ENST00000285199 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.67□□□□□ -1.82
USP43-201ENST00000285199 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.66□□□□□ -1.82
USP43-201ENST00000285199 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.62□□□□□ -1.83
USP43-201ENST00000285199 LCE1EQ5T753 118 aa3.57□□□□□ -1.84
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USP43-201ENST00000285199 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.07□□□□□ -1.92
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.06□□□□□ -1.92
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.88□□□□□ -1.95
USP43-201ENST00000285199 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.85□□□□□ -1.95
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.85□□□□□ -1.95
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.77□□□□□ -1.97
USP43-201ENST00000285199 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-8O75690 187 aa2.66□□□□□ -1.98
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.49□□□□□ -2.01
USP43-201ENST00000285199 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.48□□□□□ -2.01
USP43-201ENST00000285199 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.36□□□□□ -2.03
USP43-201ENST00000285199 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.29□□□□□ -2.04
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.21□□□□□ -2.05
USP43-201ENST00000285199 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
USP43-201ENST00000285199 PHGR1C9JFL3 82 aa2.12□□□□□ -2.07
USP43-201ENST00000285199 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
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