RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.46□□□□□ -1.38
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.43□□□□□ -1.38
GDPD1-201ENST00000284116 MT1GP13640 62 aa6.4□□□□□ -1.38
GDPD1-201ENST00000284116 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.39□□□□□ -1.39
GDPD1-201ENST00000284116 MT1MQ8N339 61 aa6.35□□□□□ -1.39
GDPD1-201ENST00000284116 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.34□□□□□ -1.4
GDPD1-201ENST00000284116 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GDPD1-201ENST00000284116 A0A0A0MQY5 61 aa6.31□□□□□ -1.4
GDPD1-201ENST00000284116 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.28□□□□□ -1.4
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.28□□□□□ -1.4
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-9P26371 169 aa6.2□□□□□ -1.42
GDPD1-201ENST00000284116 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.1□□□□□ -1.43
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.1□□□□□ -1.43
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.1□□□□□ -1.43
GDPD1-201ENST00000284116 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.09□□□□□ -1.44
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6□□□□□ -1.45
GDPD1-201ENST00000284116 SPRR2EP22531 72 aa5.98□□□□□ -1.45
GDPD1-201ENST00000284116 SPRR2BP35325 72 aa5.98□□□□□ -1.45
GDPD1-201ENST00000284116 SPRR2AP35326 72 aa5.98□□□□□ -1.45
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.95□□□□□ -1.46
GDPD1-201ENST00000284116 MDN1Q9NU22 5596 aa5.93□□□□□ -1.46
GDPD1-201ENST00000284116 INE1O15225 51 aa5.86□□□□□ -1.47
GDPD1-201ENST00000284116 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GDPD1-201ENST00000284116 LCE3BQ5TA77 95 aa5.82□□□□□ -1.48
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.8□□□□□ -1.48
GDPD1-201ENST00000284116 SPRR2DP22532 72 aa5.74□□□□□ -1.49
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.71□□□□□ -1.5
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.71□□□□□ -1.5
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GDPD1-201ENST00000284116 MT1AP04731 61 aa5.66□□□□□ -1.5
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.64□□□□□ -1.51
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.53□□□□□ -1.52
GDPD1-201ENST00000284116 LCE1DQ5T752 114 aa5.46□□□□□ -1.54
GDPD1-201ENST00000284116 NEBP20929 6669 aa5.45□□□□□ -1.54
GDPD1-201ENST00000284116 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.32□□□□□ -1.56
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.27□□□□□ -1.57
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.25□□□□□ -1.57
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP12-4P60329 112 aa5.24□□□□□ -1.57
GDPD1-201ENST00000284116 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.14□□□□□ -1.59
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.13□□□□□ -1.59
GDPD1-201ENST00000284116 MT3P25713 68 aa5.11□□□□□ -1.59
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.1□□□□□ -1.59
GDPD1-201ENST00000284116 LCE4AQ5TA78 99 aa5.09□□□□□ -1.6
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.09□□□□□ -1.6
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.05□□□□□ -1.6
GDPD1-201ENST00000284116 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.04□□□□□ -1.6
GDPD1-201ENST00000284116 MT4P47944 62 aa5□□□□□ -1.61
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.93□□□□□ -1.62
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.93□□□□□ -1.62
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.84□□□□□ -1.63
GDPD1-201ENST00000284116 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.75□□□□□ -1.65
GDPD1-201ENST00000284116 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.66□□□□□ -1.66
GDPD1-201ENST00000284116 PRM1P04553 51 aa4.56□□□□□ -1.68
GDPD1-201ENST00000284116 LCE1EQ5T753 118 aa4.35□□□□□ -1.71
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.14□□□□□ -1.75
GDPD1-201ENST00000284116 MUC5ACP98088 5654 aa4.14□□□□□ -1.75
GDPD1-201ENST00000284116 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.11□□□□□ -1.75
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.11□□□□□ -1.75
GDPD1-201ENST00000284116 LCE1CQ5T751 118 aa4.07□□□□□ -1.76
GDPD1-201ENST00000284116 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.06□□□□□ -1.76
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-8O75690 187 aa4.02□□□□□ -1.77
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.95□□□□□ -1.78
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
GDPD1-201ENST00000284116 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.7□□□□□ -1.82
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.68□□□□□ -1.82
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.54□□□□□ -1.84
GDPD1-201ENST00000284116 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.28□□□□□ -1.88
GDPD1-201ENST00000284116 LCE1FQ5T754 118 aa3.1□□□□□ -1.91
GDPD1-201ENST00000284116 PHGR1C9JFL3 82 aa3.05□□□□□ -1.92
GDPD1-201ENST00000284116 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.84□□□□□ -1.95
GDPD1-201ENST00000284116 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.72□□□□□ -1.97
GDPD1-201ENST00000284116 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.02□□□□□ -2.09
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