RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 MT1EP04732 61 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPC1-201ENST00000273482 MT1LQ93083 61 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPC1-201ENST00000273482 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.63□□□□□ -1.51
TRPC1-201ENST00000273482 KMT2DO14686 5537 aa5.63□□□□□ -1.51
TRPC1-201ENST00000273482 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TRPC1-201ENST00000273482 LCE3BQ5TA77 95 aa5.59□□□□□ -1.51
TRPC1-201ENST00000273482 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.59□□□□□ -1.52
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2DP22532 72 aa5.55□□□□□ -1.52
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.53□□□□□ -1.52
TRPC1-201ENST00000273482 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPC1-201ENST00000273482 MT1MQ8N339 61 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.45□□□□□ -1.54
TRPC1-201ENST00000273482 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPC1-201ENST00000273482 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
TRPC1-201ENST00000273482 SSPOA2VEC9 5147 aa5.4□□□□□ -1.55
TRPC1-201ENST00000273482 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.34□□□□□ -1.55
TRPC1-201ENST00000273482 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.31□□□□□ -1.56
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.29□□□□□ -1.56
TRPC1-201ENST00000273482 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.28□□□□□ -1.56
TRPC1-201ENST00000273482 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
TRPC1-201ENST00000273482 PRM1P04553 51 aa5.07□□□□□ -1.6
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.07□□□□□ -1.6
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRPC1-201ENST00000273482 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.05□□□□□ -1.6
TRPC1-201ENST00000273482 MT4P47944 62 aa5.04□□□□□ -1.6
TRPC1-201ENST00000273482 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.03□□□□□ -1.6
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.01□□□□□ -1.61
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.95□□□□□ -1.62
TRPC1-201ENST00000273482 MT1AP04731 61 aa4.9□□□□□ -1.63
TRPC1-201ENST00000273482 MT3P25713 68 aa4.85□□□□□ -1.63
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.84□□□□□ -1.63
TRPC1-201ENST00000273482 MDN1Q9NU22 5596 aa4.77□□□□□ -1.65
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-9P26371 169 aa4.67□□□□□ -1.66
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.63□□□□□ -1.67
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.63□□□□□ -1.67
TRPC1-201ENST00000273482 LCE1DQ5T752 114 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPC1-201ENST00000273482 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.52□□□□□ -1.69
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.5□□□□□ -1.69
TRPC1-201ENST00000273482 NEBP20929 6669 aa4.49□□□□□ -1.69
TRPC1-201ENST00000273482 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.46□□□□□ -1.7
TRPC1-201ENST00000273482 LCE4AQ5TA78 99 aa4.41□□□□□ -1.7
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.3□□□□□ -1.72
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.09□□□□□ -1.75
TRPC1-201ENST00000273482 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.88□□□□□ -1.79
TRPC1-201ENST00000273482 MUC5ACP98088 5654 aa3.81□□□□□ -1.8
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.79□□□□□ -1.8
TRPC1-201ENST00000273482 LCE1EQ5T753 118 aa3.79□□□□□ -1.8
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.76□□□□□ -1.81
TRPC1-201ENST00000273482 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.76□□□□□ -1.81
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.59□□□□□ -1.83
TRPC1-201ENST00000273482 LCE1CQ5T751 118 aa3.58□□□□□ -1.84
TRPC1-201ENST00000273482 LCE1FQ5T754 118 aa3.58□□□□□ -1.84
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.46□□□□□ -1.86
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.42□□□□□ -1.86
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.42□□□□□ -1.86
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPC1-201ENST00000273482 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.38□□□□□ -1.87
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.36□□□□□ -1.87
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-8O75690 187 aa3.21□□□□□ -1.9
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.16□□□□□ -1.9
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.01□□□□□ -1.93
TRPC1-201ENST00000273482 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRPC1-201ENST00000273482 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.75□□□□□ -1.97
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.72□□□□□ -1.97
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.61□□□□□ -1.99
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.49□□□□□ -2.01
TRPC1-201ENST00000273482 PHGR1C9JFL3 82 aa2.37□□□□□ -2.03
TRPC1-201ENST00000273482 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.58□□□□□ -2.16
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