RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.3□□□□□ -1.72
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UBXN4-201ENST00000272638 MT1EP04732 61 aa4.27□□□□□ -1.73
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UBXN4-201ENST00000272638 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.39□□□□□ -2.03
UBXN4-201ENST00000272638 LCE1CQ5T751 118 aa2.37□□□□□ -2.03
UBXN4-201ENST00000272638 LCE1FQ5T754 118 aa2.37□□□□□ -2.03
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.29□□□□□ -2.04
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UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.83□□□□□ -2.12
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.77□□□□□ -2.13
UBXN4-201ENST00000272638 PHGR1C9JFL3 82 aa1.72□□□□□ -2.13
UBXN4-201ENST00000272638 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.13□□□□□ -2.23
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