RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.6□□□□□ -1.67
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TMOD1-201ENST00000259365 MT1GP13640 62 aa4.53□□□□□ -1.68
TMOD1-201ENST00000259365 MT1EP04732 61 aa4.52□□□□□ -1.69
TMOD1-201ENST00000259365 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TMOD1-201ENST00000259365 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
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TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.39□□□□□ -1.71
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.39□□□□□ -1.71
TMOD1-201ENST00000259365 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.34□□□□□ -1.71
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TMOD1-201ENST00000259365 MT1MQ8N339 61 aa4.26□□□□□ -1.73
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.25□□□□□ -1.73
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TMOD1-201ENST00000259365 SPRR2AP35326 72 aa3.87□□□□□ -1.79
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TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.2□□□□□ -1.9
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TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD1-201ENST00000259365 MUC5ACP98088 5654 aa3.03□□□□□ -1.92
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TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.95□□□□□ -1.94
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TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD1-201ENST00000259365 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
TMOD1-201ENST00000259365 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.56□□□□□ -2
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.56□□□□□ -2
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD1-201ENST00000259365 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD1-201ENST00000259365 LCE1CQ5T751 118 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP5-8O75690 187 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.1□□□□□ -2.07
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.06□□□□□ -2.08
TMOD1-201ENST00000259365 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
TMOD1-201ENST00000259365 PHGR1C9JFL3 82 aa1.84□□□□□ -2.11
TMOD1-201ENST00000259365 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.27□□□□□ -2.21
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