RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pttg1ipQ8R143 174 aa7.5□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr830Q8VFJ5 315 aa7.5□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa7.5□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa7.5□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trdv1A0A075B657 112 aa7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 H2al1jA2BFR3 109 aa7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Psg18B2RSG7 476 aa7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm20422E9PUR3 255 aa7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prm1P02319 51 aa7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fgf4P11403 202 aa7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sumo1P63166 101 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tm2d1Q99MB3 208 aa7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyb5r3Q9DCN2 301 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrp2A2ARV4 4660 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ubr4A2AN08 5180 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trav6n-5A0A075B621 112 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm28845A0A087WR76 214 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyb561d1A2AE42 229 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gp9O88186 177 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mtco2P00405 227 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Evi2aP20934 223 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Morn3Q8C5T4 241 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vmn1r66Q8K4I0 310 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr365Q8VFT2 312 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 RetnQ99P87 114 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Q9CQT9 129 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem208Q9CR96 173 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ush2AQ2QI47 5193 aa7.48□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trbv3A0A0A6YYE2 117 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm7735D3YX18 52 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nat8f7E0CYR6 227 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc25a5P51881 298 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ParlQ5XJY4 377 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ifna11Q61716 190 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nup62Q63850 526 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr982Q8VGB3 321 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Klk7Q91VE3 249 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AhspQ9CY02 102 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Efcab10Q9D581 132 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem263Q9DAM7 115 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vax2Q9WTP9 292 aa7.47□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tnfsf11O35235 316 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Itgb1bp1O35671 200 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pax2P32114 414 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rab19P35294 217 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ube2g2P60605 165 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GchfrP99025 84 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gal3st4Q3V1B8 480 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr996Q7TRA0 314 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm10118Q8C8J5 116 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AmtQ8CFA2 403 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Med28Q920D3 178 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tnfrsf13cQ9D8D0 175 aa7.46□□□□□ -1.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm9964E9Q9S5 144 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm37240E9QAY5 252 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ighv1-62-3P01754 117 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Csn2P10598 231 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr317Q5NCD6 327 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CenpxQ8C4X1 78 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mpv17lQ99MS3 194 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lyg1Q9D7Q0 197 aa7.45□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Igkv4-81A0A0G2JEY5 119 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CampP51437 172 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Megf9Q8BH27 600 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Q8C3M9 231 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 C130073F10RikQ8C4L8 201 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm14137Q8CE97 175 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr33Q8VGX7 318 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ctnnbip1Q9JJN6 81 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm21900J3QP38 180 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Klk9Q32M27 251 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cd300lbQ3U497 209 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mbd3l2Q3UXB0 228 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 RetnlgQ8K426 117 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr968Q8VFN4 314 aa7.44□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 4930444P10RikD3YUR1 185 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 P01738 130 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cxcl2P10889 100 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf239P24399 201 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AsipQ03288 131 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr1373Q7TQT6 311 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr1246Q7TQZ6 314 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Olfr745Q7TRL9 328 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif5a2Q8BGY2 153 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Higd1bQ99JY6 98 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PifoQ9D9W1 207 aa7.43□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68 ms