Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ifna11Q61716 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Ifna11Q61716 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ifna11Q61716 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ifna11Q61716 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ifna11Q61716 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Ifna11Q61716 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ifna11Q61716 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ifna11Q61716 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ifna11Q61716 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ifna11Q61716 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ifna11Q61716 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ifna11Q61716 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ifna11Q61716 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Ifna11Q61716 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ifna11Q61716 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ifna11Q61716 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Ifna11Q61716 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ifna11Q61716 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ifna11Q61716 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ifna11Q61716 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ifna11Q61716 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Ifna11Q61716 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ifna11Q61716 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ifna11Q61716 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ifna11Q61716 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ifna11Q61716 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ifna11Q61716 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
Ifna11Q61716 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna11Q61716 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ifna11Q61716 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ifna11Q61716 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ifna11Q61716 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ifna11Q61716 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Ifna11Q61716 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ifna11Q61716 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ifna11Q61716 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ifna11Q61716 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ifna11Q61716 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Ifna11Q61716 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,37■■□□□ 1,17
Ifna11Q61716 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Ifna11Q61716 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ifna11Q61716 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ifna11Q61716 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ifna11Q61716 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ifna11Q61716 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ifna11Q61716 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Ifna11Q61716 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
Ifna11Q61716 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ifna11Q61716 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Ifna11Q61716 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Ifna11Q61716 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ifna11Q61716 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ifna11Q61716 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ifna11Q61716 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ifna11Q61716 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ifna11Q61716 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Ifna11Q61716 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ifna11Q61716 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ifna11Q61716 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ifna11Q61716 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ifna11Q61716 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ifna11Q61716 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Ifna11Q61716 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ifna11Q61716 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ifna11Q61716 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Ifna11Q61716 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,68■■□□□ 1,06
Ifna11Q61716 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Ifna11Q61716 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Ifna11Q61716 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ifna11Q61716 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ifna11Q61716 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ifna11Q61716 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Ifna11Q61716 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Ifna11Q61716 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ifna11Q61716 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ifna11Q61716 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ifna11Q61716 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Ifna11Q61716 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ifna11Q61716 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ifna11Q61716 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ifna11Q61716 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ifna11Q61716 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Ifna11Q61716 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ifna11Q61716 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ifna11Q61716 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ifna11Q61716 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ifna11Q61716 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ifna11Q61716 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ifna11Q61716 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ifna11Q61716 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ifna11Q61716 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ifna11Q61716 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ifna11Q61716 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ifna11Q61716 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ifna11Q61716 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ifna11Q61716 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ifna11Q61716 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ifna11Q61716 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ifna11Q61716 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,7 ms