Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifna11Q61716 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ifna11Q61716 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifna11Q61716 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifna11Q61716 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifna11Q61716 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifna11Q61716 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifna11Q61716 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifna11Q61716 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifna11Q61716 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifna11Q61716 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifna11Q61716 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifna11Q61716 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifna11Q61716 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifna11Q61716 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifna11Q61716 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifna11Q61716 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifna11Q61716 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifna11Q61716 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifna11Q61716 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifna11Q61716 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifna11Q61716 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifna11Q61716 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna11Q61716 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna11Q61716 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifna11Q61716 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifna11Q61716 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifna11Q61716 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifna11Q61716 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna11Q61716 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifna11Q61716 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifna11Q61716 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifna11Q61716 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifna11Q61716 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifna11Q61716 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifna11Q61716 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifna11Q61716 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifna11Q61716 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifna11Q61716 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifna11Q61716 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifna11Q61716 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifna11Q61716 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifna11Q61716 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifna11Q61716 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifna11Q61716 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifna11Q61716 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifna11Q61716 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifna11Q61716 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifna11Q61716 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifna11Q61716 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifna11Q61716 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifna11Q61716 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifna11Q61716 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifna11Q61716 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna11Q61716 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna11Q61716 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifna11Q61716 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna11Q61716 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifna11Q61716 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifna11Q61716 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifna11Q61716 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifna11Q61716 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifna11Q61716 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifna11Q61716 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifna11Q61716 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifna11Q61716 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifna11Q61716 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifna11Q61716 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna11Q61716 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifna11Q61716 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifna11Q61716 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna11Q61716 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna11Q61716 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifna11Q61716 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifna11Q61716 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna11Q61716 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna11Q61716 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna11Q61716 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna11Q61716 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifna11Q61716 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna11Q61716 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna11Q61716 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifna11Q61716 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna11Q61716 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifna11Q61716 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifna11Q61716 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna11Q61716 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna11Q61716 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna11Q61716 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna11Q61716 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifna11Q61716 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifna11Q61716 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna11Q61716 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna11Q61716 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna11Q61716 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifna11Q61716 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifna11Q61716 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ifna11Q61716 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifna11Q61716 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifna11Q61716 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms