Protein–RNA interactions for Protein: P32114

Pax2, Paired box protein Pax-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax2P32114 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Pax2P32114 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Pax2P32114 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Pax2P32114 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Pax2P32114 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Pax2P32114 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Pax2P32114 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Pax2P32114 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Pax2P32114 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Pax2P32114 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Pax2P32114 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Pax2P32114 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Pax2P32114 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Pax2P32114 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Pax2P32114 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Pax2P32114 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Pax2P32114 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Pax2P32114 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Pax2P32114 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Pax2P32114 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Pax2P32114 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Pax2P32114 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Pax2P32114 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Pax2P32114 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Pax2P32114 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Pax2P32114 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Pax2P32114 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Pax2P32114 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Pax2P32114 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Pax2P32114 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Pax2P32114 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Pax2P32114 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Pax2P32114 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Pax2P32114 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Pax2P32114 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Pax2P32114 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Pax2P32114 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
Pax2P32114 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Pax2P32114 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Pax2P32114 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Pax2P32114 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Pax2P32114 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Pax2P32114 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Pax2P32114 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Pax2P32114 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Pax2P32114 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Pax2P32114 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Pax2P32114 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Pax2P32114 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Pax2P32114 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Pax2P32114 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Pax2P32114 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Pax2P32114 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Pax2P32114 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Pax2P32114 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Pax2P32114 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Pax2P32114 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Pax2P32114 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Pax2P32114 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Pax2P32114 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Pax2P32114 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Pax2P32114 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Pax2P32114 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Pax2P32114 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Pax2P32114 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Pax2P32114 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Pax2P32114 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Pax2P32114 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Pax2P32114 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Pax2P32114 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Pax2P32114 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Pax2P32114 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Pax2P32114 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Pax2P32114 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Pax2P32114 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Pax2P32114 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Pax2P32114 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Pax2P32114 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Pax2P32114 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Pax2P32114 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Pax2P32114 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Pax2P32114 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Pax2P32114 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
Pax2P32114 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Pax2P32114 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Pax2P32114 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Pax2P32114 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Pax2P32114 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Pax2P32114 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Pax2P32114 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Pax2P32114 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Pax2P32114 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
Pax2P32114 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms