Protein–RNA interactions for Protein: P32114

Pax2, Paired box protein Pax-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax2P32114 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pax2P32114 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pax2P32114 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pax2P32114 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pax2P32114 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pax2P32114 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pax2P32114 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pax2P32114 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pax2P32114 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pax2P32114 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pax2P32114 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pax2P32114 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pax2P32114 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pax2P32114 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pax2P32114 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pax2P32114 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pax2P32114 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pax2P32114 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pax2P32114 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pax2P32114 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pax2P32114 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pax2P32114 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pax2P32114 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pax2P32114 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pax2P32114 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pax2P32114 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pax2P32114 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pax2P32114 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pax2P32114 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax2P32114 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pax2P32114 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax2P32114 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax2P32114 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax2P32114 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax2P32114 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax2P32114 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax2P32114 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pax2P32114 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pax2P32114 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pax2P32114 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pax2P32114 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pax2P32114 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pax2P32114 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax2P32114 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax2P32114 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pax2P32114 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pax2P32114 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax2P32114 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax2P32114 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax2P32114 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax2P32114 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax2P32114 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax2P32114 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax2P32114 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax2P32114 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax2P32114 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax2P32114 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax2P32114 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax2P32114 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pax2P32114 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax2P32114 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax2P32114 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax2P32114 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax2P32114 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pax2P32114 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax2P32114 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax2P32114 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax2P32114 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax2P32114 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax2P32114 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax2P32114 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax2P32114 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax2P32114 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax2P32114 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pax2P32114 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pax2P32114 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pax2P32114 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax2P32114 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pax2P32114 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pax2P32114 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax2P32114 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pax2P32114 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pax2P32114 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pax2P32114 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pax2P32114 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax2P32114 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax2P32114 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pax2P32114 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax2P32114 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax2P32114 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax2P32114 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pax2P32114 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pax2P32114 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms