RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641923.1

SAMMSON-223, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

Gene SAMMSON, Length 1,213 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-223	ENST00000641923	CASC2	Q6XLA1	102 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SAMMSON-223	ENST00000641923	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	COA5	Q86WW8	74 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	PRR4	Q16378	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923		Q96NJ1	140 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SAMMSON-223	ENST00000641923	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-223	ENST00000641923	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-223	ENST00000641923		A0A1B0GVX0	72 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SAMMSON-223	ENST00000641923	ACYP2	P14621	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SAMMSON-223	ENST00000641923	LINC00313	P59037	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	HERC1	Q15751	4861 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-223	ENST00000641923	UQCR11	O14957	56 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	HRES1	P13985	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923		A8MUU9	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923		A0A1B0GU69	56 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923		A8MU10	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPINK7	P58062	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAMMSON-223	ENST00000641923	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-223	ENST00000641923	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SAMMSON-223	ENST00000641923	LRP2	P98164	4655 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SAMMSON-223	ENST00000641923	LPA	P08519	4548 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SAMMSON-223	ENST00000641923	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SAMMSON-223	ENST00000641923	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-223	ENST00000641923		Q5W150	140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-223	ENST00000641923	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SAMMSON-223	ENST00000641923		K7ERS5	55 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SAMMSON-223	ENST00000641923	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	ROMO1	P60602	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SAMMSON-223	ENST00000641923	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SAMMSON-223	ENST00000641923	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAMMSON-223	ENST00000641923	MUC2	Q02817	5179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAMMSON-223	ENST00000641923		A0A1B0GU33	70 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SAMMSON-223	ENST00000641923	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SAMMSON-223	ENST00000641923	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
SAMMSON-223	ENST00000641923		M0R2T5	61 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SAMMSON-223	ENST00000641923	MT1H	P80294	61 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SAMMSON-223	ENST00000641923		H0YAA0	97 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SAMMSON-223	ENST00000641923		S4R3F8	94 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SAMMSON-223	ENST00000641923	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.33	□□□□□ -1.72
SAMMSON-223	ENST00000641923	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
SAMMSON-223	ENST00000641923		P0C880	135 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SAMMSON-223	ENST00000641923	MT2A	P02795	61 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SAMMSON-223	ENST00000641923	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SAMMSON-223	ENST00000641923		M0QZ58	72 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SAMMSON-223	ENST00000641923	MT1F	P04733	61 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SAMMSON-223	ENST00000641923		A0A0A0MQY5	61 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SAMMSON-223	ENST00000641923		R4GN34	69 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SAMMSON-223	ENST00000641923	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SAMMSON-223	ENST00000641923	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SAMMSON-223	ENST00000641923		A0A0D9SG42	100 aa		4	□□□□□ -1.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PLAC4	Q8WY50	150 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	MT1B	P07438	61 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	USH2A	O75445	5202 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SAMMSON-223	ENST00000641923	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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