RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HERC2	O95714	4834 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A0D9SG42	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RYR1	P21817	5038 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PKD1	P98161	4303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNTNAP2-222	ENST00000637694		S4R3F8	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSPG2	P98160	4391 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A1B0GVY2	172 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.4	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.4	□□□□□ -1.7
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HERC1	Q15751	4861 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.33	□□□□□ -1.72
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAT1	Q14517	4588 aa		4.33	□□□□□ -1.72
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CNTNAP2-222	ENST00000637694		M0QZ58	72 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694		Q5VSD8	79 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TNXB	P22105	4242 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694		R4GN34	69 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRP2	P98164	4655 aa		4	□□□□□ -1.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LPA	P08519	4548 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INE1	O15225	51 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MUC2	Q02817	5179 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TNP1	P09430	55 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.71	□□□□□ -1.81
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MUC17	Q685J3	4493 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1H	P80294	61 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USH2A	O75445	5202 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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