RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619529.1

LINC00854-215, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-215	ENST00000619529	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-215	ENST00000619529	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-215	ENST00000619529	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-215	ENST00000619529	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-215	ENST00000619529	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-215	ENST00000619529		A0A087WVE0	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00854-215	ENST00000619529	NDUFS5	O43920	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC00854-215	ENST00000619529	PCP4	P48539	62 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	ATOX1	O00244	68 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LINC00854-215	ENST00000619529	UQCRQ	O14949	82 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529		Q5W150	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529	MT1B	P07438	61 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529		A6NN06	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC00854-215	ENST00000619529		H0Y9P7	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	KMT2D	O14686	5537 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	COX7C	P15954	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	MP68	P56378	58 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529		H3BPC8	53 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529		Q5VV11	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-215	ENST00000619529	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-215	ENST00000619529	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-215	ENST00000619529	NDUFC1	O43677	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-215	ENST00000619529	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-215	ENST00000619529	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-215	ENST00000619529	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529	TMEM258	P61165	79 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529	LCA10	Q71F78	164 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529		S4R3F8	94 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LINC00854-215	ENST00000619529		A8MUN3	132 aa		4.44	□□□□□ -1.7
LINC00854-215	ENST00000619529		H7BZZ5	65 aa		4.44	□□□□□ -1.7
LINC00854-215	ENST00000619529	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.41	□□□□□ -1.7
LINC00854-215	ENST00000619529	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.41	□□□□□ -1.7
LINC00854-215	ENST00000619529	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	SPRR2E	P22531	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	SPRR2B	P35325	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	SPRR2A	P35326	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	ACYP2	P14621	99 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC00854-215	ENST00000619529	MT1X	P80297	61 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC00854-215	ENST00000619529	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC00854-215	ENST00000619529	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.29	□□□□□ -1.72
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.28	□□□□□ -1.72
LINC00854-215	ENST00000619529	COA5	Q86WW8	74 aa		4.27	□□□□□ -1.73
LINC00854-215	ENST00000619529	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LINC00854-215	ENST00000619529	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LINC00854-215	ENST00000619529		H0YAA0	97 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINC00854-215	ENST00000619529	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINC00854-215	ENST00000619529	SPRR2D	P22532	72 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINC00854-215	ENST00000619529	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINC00854-215	ENST00000619529		V9GYY9	64 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINC00854-215	ENST00000619529	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINC00854-215	ENST00000619529		Q1T7F1	81 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINC00854-215	ENST00000619529		P0C880	135 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINC00854-215	ENST00000619529	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINC00854-215	ENST00000619529	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINC00854-215	ENST00000619529	SEC61G	P60059	68 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINC00854-215	ENST00000619529	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00854-215	ENST00000619529		R4GN34	69 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINC00854-215	ENST00000619529		M0QZ58	72 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00854-215	ENST00000619529	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LINC00854-215	ENST00000619529		A0A1B0GU69	56 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LINC00854-215	ENST00000619529	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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