RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 RYR2Q92736 4967 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRT-211ENST00000618610 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 PKD1P98161 4303 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf92A6NGG3 77 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 TPRXLQ17RH7 258 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0D9SG42 100 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 K7ERS5 55 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRT-211ENST00000618610 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRT-211ENST00000618610 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRT-211ENST00000618610 RYR1P21817 5038 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRT-211ENST00000618610 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 HSPG2P98160 4391 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 LPAP08519 4548 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 MUC2Q02817 5179 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRT-211ENST00000618610 LRP2P98164 4655 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRT-211ENST00000618610 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRT-211ENST00000618610 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRT-211ENST00000618610 LUZP6Q538Z0 58 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP12-2P59991 146 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRT-211ENST00000618610 S4R3F8 94 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRT-211ENST00000618610 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRT-211ENST00000618610 HERC2O95714 4834 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GVY2 172 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRT-211ENST00000618610 RNF213Q63HN8 5207 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRT-211ENST00000618610 Q5VSD8 79 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRT-211ENST00000618610 HERC1Q15751 4861 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP12-1P59990 96 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRT-211ENST00000618610 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-8P60410 259 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRT-211ENST00000618610 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRT-211ENST00000618610 XP32Q5T750 250 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRT-211ENST00000618610 TNXBP22105 4242 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRT-211ENST00000618610 PLAC4Q8WY50 150 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRT-211ENST00000618610 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRT-211ENST00000618610 MT1HL1P0DM35 61 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRT-211ENST00000618610 M0QZ58 72 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRT-211ENST00000618610 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRT-211ENST00000618610 R4GN34 69 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRT-211ENST00000618610 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRT-211ENST00000618610 USH2AO75445 5202 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRT-211ENST00000618610 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRT-211ENST00000618610 MUC17Q685J3 4493 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-211ENST00000618610 PP632Q6XCG6 107 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRT-211ENST00000618610 M0R2T5 61 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRT-211ENST00000618610 KMT2DO14686 5537 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRT-211ENST00000618610 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-211ENST00000618610 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRT-211ENST00000618610 TNP1P09430 55 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRT-211ENST00000618610 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRT-211ENST00000618610 INE1O15225 51 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-10P60014 251 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRT-211ENST00000618610 LCE3AQ5TA76 89 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRT-211ENST00000618610 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRT-211ENST00000618610 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRT-211ENST00000618610 MT1FP04733 61 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRT-211ENST00000618610 MT1HP80294 61 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRT-211ENST00000618610 LCE4AQ5TA78 99 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRT-211ENST00000618610 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRT-211ENST00000618610 MT2AP02795 61 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRT-211ENST00000618610 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 SSPOA2VEC9 5147 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP12-3P60328 96 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-12P60413 245 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-211ENST00000618610 MT1BP07438 61 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-211ENST00000618610 KRTAP10-5P60370 271 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRT-211ENST00000618610 MT1XP80297 61 aa3.09□□□□□ -1.92
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