RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CTCFL-222	ENST00000609232	MUC2	Q02817	5179 aa		5.46	□□□□□ -1.53
CTCFL-222	ENST00000609232	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CTCFL-222	ENST00000609232		P0C880	135 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CTCFL-222	ENST00000609232	LRP2	P98164	4655 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CTCFL-222	ENST00000609232	HSPG2	P98160	4391 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CTCFL-222	ENST00000609232	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A0D9SG42	100 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232		A8MUU9	505 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP10-8	P60410	259 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232	LPA	P08519	4548 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CTCFL-222	ENST00000609232		K7ERS5	55 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CTCFL-222	ENST00000609232	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CTCFL-222	ENST00000609232	HERC1	Q15751	4861 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CTCFL-222	ENST00000609232	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CTCFL-222	ENST00000609232	HERC2	O95714	4834 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CTCFL-222	ENST00000609232	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CTCFL-222	ENST00000609232	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CTCFL-222	ENST00000609232	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1B0GU33	70 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CTCFL-222	ENST00000609232		H0YAA0	97 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CTCFL-222	ENST00000609232	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TNXB	P22105	4242 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CTCFL-222	ENST00000609232	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CTCFL-222	ENST00000609232	XP32	Q5T750	250 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CTCFL-222	ENST00000609232	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CTCFL-222	ENST00000609232	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CTCFL-222	ENST00000609232	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CTCFL-222	ENST00000609232	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTCFL-222	ENST00000609232	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CTCFL-222	ENST00000609232		M0R2T5	61 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTCFL-222	ENST00000609232		S4R3F8	94 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTCFL-222	ENST00000609232		M0QZ58	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTCFL-222	ENST00000609232		R4GN34	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTCFL-222	ENST00000609232	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTCFL-222	ENST00000609232	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTCFL-222	ENST00000609232	USH2A	O75445	5202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTCFL-222	ENST00000609232	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTCFL-222	ENST00000609232	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTCFL-222	ENST00000609232	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTCFL-222	ENST00000609232	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTCFL-222	ENST00000609232	KMT2D	O14686	5537 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTCFL-222	ENST00000609232	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CTCFL-222	ENST00000609232	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MT1H	P80294	61 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.32	□□□□□ -1.72
CTCFL-222	ENST00000609232	MT2A	P02795	61 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CTCFL-222	ENST00000609232	MT1F	P04733	61 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CTCFL-222	ENST00000609232	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TNP1	P09430	55 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CTCFL-222	ENST00000609232	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CTCFL-222	ENST00000609232	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CTCFL-222	ENST00000609232	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CTCFL-222	ENST00000609232	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CTCFL-222	ENST00000609232	INE1	O15225	51 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTCFL-222	ENST00000609232	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTCFL-222	ENST00000609232	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MT1B	P07438	61 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CTCFL-222	ENST00000609232	LCE2B	O14633	110 aa		4	□□□□□ -1.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4	□□□□□ -1.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4	□□□□□ -1.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MT1X	P80297	61 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTCFL-222	ENST00000609232	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CTCFL-222	ENST00000609232	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.69	□□□□□ -1.82

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