RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597965.2

PNKP-210, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.07□□□□□ -1.12
PNKP-210ENST00000597965 NDUFS5O43920 106 aa8.06□□□□□ -1.12
PNKP-210ENST00000597965 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.05□□□□□ -1.12
PNKP-210ENST00000597965 H0Y9P7 68 aa8.04□□□□□ -1.12
PNKP-210ENST00000597965 H3BPC8 53 aa8.03□□□□□ -1.12
PNKP-210ENST00000597965 MP68P56378 58 aa8.03□□□□□ -1.12
PNKP-210ENST00000597965 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.02□□□□□ -1.13
PNKP-210ENST00000597965 H7BZZ5 65 aa8.01□□□□□ -1.13
PNKP-210ENST00000597965 NDUFC1O43677 76 aa8□□□□□ -1.13
PNKP-210ENST00000597965 Q5W150 140 aa7.99□□□□□ -1.13
PNKP-210ENST00000597965 LINC00208Q96KT6 92 aa7.99□□□□□ -1.13
PNKP-210ENST00000597965 TMEM258P61165 79 aa7.96□□□□□ -1.14
PNKP-210ENST00000597965 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.96□□□□□ -1.14
PNKP-210ENST00000597965 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.89□□□□□ -1.15
PNKP-210ENST00000597965 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.88□□□□□ -1.15
PNKP-210ENST00000597965 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.87□□□□□ -1.15
PNKP-210ENST00000597965 IGKV2-30P06310 120 aa7.87□□□□□ -1.15
PNKP-210ENST00000597965 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.85□□□□□ -1.15
PNKP-210ENST00000597965 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PNKP-210ENST00000597965 A6NN06 94 aa7.81□□□□□ -1.16
PNKP-210ENST00000597965 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.81□□□□□ -1.16
PNKP-210ENST00000597965 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PNKP-210ENST00000597965 C4orf26Q17RF5 130 aa7.75□□□□□ -1.17
PNKP-210ENST00000597965 Q5VV11 94 aa7.75□□□□□ -1.17
PNKP-210ENST00000597965 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.73□□□□□ -1.17
PNKP-210ENST00000597965 CSAG1Q6PB30 78 aa7.7□□□□□ -1.18
PNKP-210ENST00000597965 NEBP20929 6669 aa7.68□□□□□ -1.18
PNKP-210ENST00000597965 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.67□□□□□ -1.18
PNKP-210ENST00000597965 S4R3F8 94 aa7.67□□□□□ -1.18
PNKP-210ENST00000597965 MT1BP07438 61 aa7.66□□□□□ -1.18
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.65□□□□□ -1.18
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.63□□□□□ -1.19
PNKP-210ENST00000597965 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.62□□□□□ -1.19
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP10-5P60370 271 aa7.61□□□□□ -1.19
PNKP-210ENST00000597965 DMAC1Q96GE9 116 aa7.6□□□□□ -1.19
PNKP-210ENST00000597965 LCA10Q71F78 164 aa7.58□□□□□ -1.2
PNKP-210ENST00000597965 COA5Q86WW8 74 aa7.57□□□□□ -1.2
PNKP-210ENST00000597965 ACYP2P14621 99 aa7.56□□□□□ -1.2
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP5-9P26371 169 aa7.56□□□□□ -1.2
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.56□□□□□ -1.2
PNKP-210ENST00000597965 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.54□□□□□ -1.2
PNKP-210ENST00000597965 CRIPTQ9P021 101 aa7.52□□□□□ -1.21
PNKP-210ENST00000597965 A8MUN3 132 aa7.5□□□□□ -1.21
PNKP-210ENST00000597965 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.4□□□□□ -1.22
PNKP-210ENST00000597965 KMT2DO14686 5537 aa7.4□□□□□ -1.23
PNKP-210ENST00000597965 Q1T7F1 81 aa7.39□□□□□ -1.23
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.39□□□□□ -1.23
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.37□□□□□ -1.23
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.37□□□□□ -1.23
PNKP-210ENST00000597965 MDN1Q9NU22 5596 aa7.33□□□□□ -1.24
PNKP-210ENST00000597965 V9GYY9 64 aa7.33□□□□□ -1.24
PNKP-210ENST00000597965 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.32□□□□□ -1.24
PNKP-210ENST00000597965 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.31□□□□□ -1.24
PNKP-210ENST00000597965 H0YAA0 97 aa7.3□□□□□ -1.24
PNKP-210ENST00000597965 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.27□□□□□ -1.25
PNKP-210ENST00000597965 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.26□□□□□ -1.25
PNKP-210ENST00000597965 SPRR2EP22531 72 aa7.23□□□□□ -1.25
PNKP-210ENST00000597965 SPRR2BP35325 72 aa7.23□□□□□ -1.25
PNKP-210ENST00000597965 SPRR2AP35326 72 aa7.23□□□□□ -1.25
PNKP-210ENST00000597965 PSPHP1O15172 72 aa7.21□□□□□ -1.26
PNKP-210ENST00000597965 PRR15LQ9BU68 103 aa7.21□□□□□ -1.26
PNKP-210ENST00000597965 PLAC4Q8WY50 150 aa7.18□□□□□ -1.26
PNKP-210ENST00000597965 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.16□□□□□ -1.26
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.16□□□□□ -1.26
PNKP-210ENST00000597965 A0A1B0GU69 56 aa7.13□□□□□ -1.27
PNKP-210ENST00000597965 MT1XP80297 61 aa7.12□□□□□ -1.27
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.12□□□□□ -1.27
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.12□□□□□ -1.27
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP12-2P59991 146 aa7.08□□□□□ -1.28
PNKP-210ENST00000597965 R4GN34 69 aa7.07□□□□□ -1.28
PNKP-210ENST00000597965 SEC61GP60059 68 aa7.06□□□□□ -1.28
PNKP-210ENST00000597965 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.06□□□□□ -1.28
PNKP-210ENST00000597965 SPRR2DP22532 72 aa7.01□□□□□ -1.29
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7□□□□□ -1.29
PNKP-210ENST00000597965 A6NED7 52 aa6.98□□□□□ -1.29
PNKP-210ENST00000597965 M0QZ58 72 aa6.95□□□□□ -1.3
PNKP-210ENST00000597965 BRK1Q8WUW1 75 aa6.94□□□□□ -1.3
PNKP-210ENST00000597965 UQCR11O14957 56 aa6.93□□□□□ -1.3
PNKP-210ENST00000597965 A0A1B0GU33 70 aa6.92□□□□□ -1.3
PNKP-210ENST00000597965 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.9□□□□□ -1.3
PNKP-210ENST00000597965 P0C880 135 aa6.89□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.89□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.88□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 A8MU10 97 aa6.88□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.88□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.87□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 LINC01554Q52M75 96 aa6.86□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 LCE3BQ5TA77 95 aa6.84□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 PRO0628Q9UI54 55 aa6.84□□□□□ -1.31
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP10-12P60413 245 aa6.8□□□□□ -1.32
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.78□□□□□ -1.32
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PNKP-210ENST00000597965 A0A0D9SG42 100 aa6.62□□□□□ -1.35
PNKP-210ENST00000597965 PMAIP1Q13794 54 aa6.57□□□□□ -1.36
PNKP-210ENST00000597965 KRTAP12-1P59990 96 aa6.53□□□□□ -1.36
PNKP-210ENST00000597965 K7ERS5 55 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-210ENST00000597965 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PNKP-210ENST00000597965 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.46□□□□□ -1.38
PNKP-210ENST00000597965 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.46□□□□□ -1.38
PNKP-210ENST00000597965 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.44□□□□□ -1.38
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