RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587586.5

GTF3C2-AS1-204, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 529 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.18□□□□□ -1.9
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GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.59□□□□□ -1.99
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