RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRAC1Q96KF2 57 aa12.87□□□□□ -0.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADM2Q7Z4H4 148 aa12.86□□□□□ -0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa12.77□□□□□ -0.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XP32Q5T750 250 aa12.69□□□□□ -0.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL37P61927 97 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0YAA0 97 aa12.65□□□□□ -0.38
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.1□□□□□ -0.47
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 S4R3F8 94 aa12.06□□□□□ -0.48
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC2Q02817 5179 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP12-1P59990 96 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa11.52□□□□□ -0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C10orf95Q9H7T3 257 aa11.51□□□□□ -0.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0QZ58 72 aa11.48□□□□□ -0.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPINT4Q6UDR6 99 aa11.48□□□□□ -0.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BS24 57 aa11.43□□□□□ -0.58
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 R4GN34 69 aa11.16□□□□□ -0.62
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF213Q63HN8 5207 aa11.13□□□□□ -0.63
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT2AP02795 61 aa10.53□□□□□ -0.72
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PP632Q6XCG6 107 aa10.5□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa10.5□□□□□ -0.73
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa10.09□□□□□ -0.79
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE2BO14633 110 aa9.79□□□□□ -0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE3AQ5TA76 89 aa9.72□□□□□ -0.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USH2AO75445 5202 aa9.62□□□□□ -0.87
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-12P60413 245 aa9.44□□□□□ -0.9
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KMT2DO14686 5537 aa9.13□□□□□ -0.95
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.09□□□□□ -0.95
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.99□□□□□ -0.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.99□□□□□ -0.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.74□□□□□ -1.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.72□□□□□ -1.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INE1O15225 51 aa8.71□□□□□ -1.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1EP04732 61 aa8.54□□□□□ -1.04
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1LQ93083 61 aa8.44□□□□□ -1.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.42□□□□□ -1.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.38□□□□□ -1.07
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