RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 C4orf26Q17RF5 130 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-213ENST00000548746 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-213ENST00000548746 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-213ENST00000548746 ATOX1O00244 68 aa2.83□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 OCR1Q9BZK8 76 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.81□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 H0Y9P7 68 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 K7ERU9 68 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 IMUPQ9GZP8 106 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 KRTAP10-10P60014 251 aa2.79□□□□□ -1.96
CS-213ENST00000548746 H3BPC8 53 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 C5orf47Q569G3 176 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 LCA10Q71F78 164 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 SVIPQ8NHG7 77 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 S4R3F8 94 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 A8MUN3 132 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 MT-ATP8P03928 68 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 MP68P56378 58 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 USH2AO75445 5202 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 KLKP1Q107X0 134 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 CSAG1Q6PB30 78 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 LINC00208Q96KT6 92 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 SCGB1A1P11684 91 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 SSPOA2VEC9 5147 aa2.71□□□□□ -1.97
CS-213ENST00000548746 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 H0YAA0 97 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 DMAC1Q96GE9 116 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 NDUFC1O43677 76 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 CRIPTQ9P021 101 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-213ENST00000548746 SERP2Q8N6R1 65 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 MT1BP07438 61 aa2.64□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.63□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 ACYP2P14621 99 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 PCP4P48539 62 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 Q5VV11 94 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 C20orf197Q8N268 126 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 SNURFQ9Y675 71 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CS-213ENST00000548746 P0C880 135 aa2.58□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 COX7CP15954 63 aa2.58□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 KRTAP10-5P60370 271 aa2.57□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.57□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 A6NN06 94 aa2.55□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 H7BZZ5 65 aa2.55□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.54□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.54□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 R4GN34 69 aa2.54□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CS-213ENST00000548746 M0QZ58 72 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 COA5Q86WW8 74 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 MT1XP80297 61 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 PLAC4Q8WY50 150 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.47□□□□□ -2.01
CS-213ENST00000548746 A0A0A0MQY5 61 aa2.46□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 CCDC179H3BU77 68 aa2.46□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 KRTAP12-2P59991 146 aa2.45□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.45□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.45□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-9P26371 169 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 LINC01554Q52M75 96 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 NEBP20929 6669 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 SEC61GP60059 68 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-213ENST00000548746 TMEM258P61165 79 aa2.4□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 KRTAP10-12P60413 245 aa2.39□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.39□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 A0A1B0GU33 70 aa2.38□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 A0A1B0GU69 56 aa2.37□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 KMT2DO14686 5537 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 KRTAP12-1P59990 96 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-213ENST00000548746 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 PRR15LQ9BU68 103 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.32□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 A0A0D9SG42 100 aa2.32□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.32□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 MDN1Q9NU22 5596 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 A8MU10 97 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-213ENST00000548746 SPRR2EP22531 72 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 SPRR2BP35325 72 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 SPRR2AP35326 72 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms