RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 LINC00208Q96KT6 92 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 KLKP1Q107X0 134 aa4.06□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 SSPOA2VEC9 5147 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 SCGB1A1P11684 91 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 MP68P56378 58 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 IMUPQ9GZP8 106 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-211ENST00000548041 H3BPC8 53 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-211ENST00000548041 CSAG1Q6PB30 78 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-211ENST00000548041 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 A8MUN3 132 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 DMAC1Q96GE9 116 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 NDUFC1O43677 76 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 SNURFQ9Y675 71 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-211ENST00000548041 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.9□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 C20orf197Q8N268 126 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 SERP2Q8N6R1 65 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 H0YAA0 97 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 MT1BP07438 61 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-211ENST00000548041 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 ACYP2P14621 99 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 Q5VV11 94 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 CRIPTQ9P021 101 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 P0C880 135 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 COX7CP15954 63 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.79□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-211ENST00000548041 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 H7BZZ5 65 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 R4GN34 69 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 A6NN06 94 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 M0QZ58 72 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 LCE3BQ5TA77 95 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-211ENST00000548041 KRTAP10-5P60370 271 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-211ENST00000548041 COA5Q86WW8 74 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-211ENST00000548041 CCDC179H3BU77 68 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-211ENST00000548041 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CS-211ENST00000548041 LINC01554Q52M75 96 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-211ENST00000548041 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-211ENST00000548041 MT1XP80297 61 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-211ENST00000548041 PLAC4Q8WY50 150 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-211ENST00000548041 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-211ENST00000548041 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-211ENST00000548041 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-211ENST00000548041 KMT2DO14686 5537 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-211ENST00000548041 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-211ENST00000548041 SEC61GP60059 68 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-211ENST00000548041 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-211ENST00000548041 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-211ENST00000548041 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-211ENST00000548041 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-211ENST00000548041 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CS-211ENST00000548041 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.52□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 TMEM258P61165 79 aa3.51□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 A0A0D9SG42 100 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 A0A1B0GU33 70 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 A0A1B0GU69 56 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 KRTAP12-2P59991 146 aa3.48□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 KRTAP5-9P26371 169 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-211ENST00000548041 LCE1DQ5T752 114 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 PRAC1Q96KF2 57 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 A8MU10 97 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 KRTAP12-1P59990 96 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 KRTAP10-12P60413 245 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 MDN1Q9NU22 5596 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 NEBP20929 6669 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-211ENST00000548041 PRR15LQ9BU68 103 aa3.4□□□□□ -1.87
CS-211ENST00000548041 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-211ENST00000548041 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-211ENST00000548041 SPRR2EP22531 72 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-211ENST00000548041 SPRR2BP35325 72 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-211ENST00000548041 SPRR2AP35326 72 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-211ENST00000548041 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-211ENST00000548041 UQCR11O14957 56 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-211ENST00000548041 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-211ENST00000548041 PSPHP1O15172 72 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-211ENST00000548041 Q1T7F1 81 aa3.27□□□□□ -1.89
CS-211ENST00000548041 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.27□□□□□ -1.89
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