RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R2T5 61 aa4.18□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1HP80294 61 aa4.16□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCA10Q71F78 164 aa4.16□□□□□ -1.74
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COA5Q86WW8 74 aa4.15□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSAG1Q6PB30 78 aa4.14□□□□□ -1.75
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.09□□□□□ -1.75
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC61GP60059 68 aa3.99□□□□□ -1.77
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GU33 70 aa3.87□□□□□ -1.79
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.8□□□□□ -1.8
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.7□□□□□ -1.82
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1BP07438 61 aa3.68□□□□□ -1.82
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.56□□□□□ -1.84
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SVIPQ8NHG7 77 aa3.48□□□□□ -1.85
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ROMO1P60602 79 aa3.43□□□□□ -1.86
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNP1P09430 55 aa3.41□□□□□ -1.86
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.19□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.18□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.17□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KMT2DO14686 5537 aa3.17□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.16□□□□□ -1.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H3BS24 57 aa3.16□□□□□ -1.9
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.15□□□□□ -1.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-9P26371 169 aa3.14□□□□□ -1.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1EP04732 61 aa3.12□□□□□ -1.91
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