RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 A6NN06 94 aa3.59□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 K7ERS5 55 aa3.58□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 XP32Q5T750 250 aa3.58□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.57□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRAC1Q96KF2 57 aa3.56□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 A0A1B0GU33 70 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.53□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MT1HL1P0DM35 61 aa3.52□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.52□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 S4R3F8 94 aa3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAT1Q14517 4588 aa3.51□□□□□ -1.85
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 TNXBP22105 4242 aa3.48□□□□□ -1.85
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.46□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.46□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.45□□□□□ -1.86
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSPG2P98160 4391 aa3.45□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RYR1P21817 5038 aa3.45□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HERC2O95714 4834 aa3.4□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.39□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ROMO1P60602 79 aa3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.33□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.33□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.32□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CRIPTQ9P021 101 aa3.31□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.3□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MYCBP2O75592 4640 aa3.3□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.3□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.29□□□□□ -1.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 R4GN34 69 aa3.27□□□□□ -1.89
SOX9-AS1-208ENST00000529667 P0C880 135 aa3.26□□□□□ -1.89
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.25□□□□□ -1.89
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HERC1Q15751 4861 aa3.22□□□□□ -1.89
SOX9-AS1-208ENST00000529667 A0A0D9SG42 100 aa3.21□□□□□ -1.9
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.21□□□□□ -1.9
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRP2P98164 4655 aa3.2□□□□□ -1.9
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.18□□□□□ -1.9
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.15□□□□□ -1.91
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MUC17Q685J3 4493 aa3.14□□□□□ -1.91
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.1□□□□□ -1.91
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLAC4Q8WY50 150 aa3.03□□□□□ -1.92
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.03□□□□□ -1.92
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.02□□□□□ -1.93
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.01□□□□□ -1.93
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.01□□□□□ -1.93
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.99□□□□□ -1.93
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNF213Q63HN8 5207 aa2.95□□□□□ -1.94
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MT1HP80294 61 aa2.93□□□□□ -1.94
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LCE3BQ5TA77 95 aa2.92□□□□□ -1.94
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MUC2Q02817 5179 aa2.92□□□□□ -1.94
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 MT2AP02795 61 aa2.86□□□□□ -1.95
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.77□□□□□ -1.97
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.77□□□□□ -1.97
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.77□□□□□ -1.97
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LCE1DQ5T752 114 aa2.76□□□□□ -1.97
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.75□□□□□ -1.97
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.74□□□□□ -1.97
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MT1BP07438 61 aa2.74□□□□□ -1.97
SOX9-AS1-208ENST00000529667 INE1O15225 51 aa2.71□□□□□ -1.98
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP10-5P60370 271 aa2.71□□□□□ -1.98
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.71□□□□□ -1.98
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP10-12P60413 245 aa2.7□□□□□ -1.98
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MT1XP80297 61 aa2.7□□□□□ -1.98
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LCE3AQ5TA76 89 aa2.67□□□□□ -1.98
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.67□□□□□ -1.98
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP12-3P60328 96 aa2.65□□□□□ -1.99
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.63□□□□□ -1.99
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