RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527187.5

RHCE-208, Transcript of Rh blood group CcEe antigens, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RHCE, Length 1,441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCE-208ENST00000527187 H3BPC8 53 aa7.27□□□□□ -1.24
RHCE-208ENST00000527187 LINC00208Q96KT6 92 aa7.27□□□□□ -1.24
RHCE-208ENST00000527187 S4R3F8 94 aa7.27□□□□□ -1.24
RHCE-208ENST00000527187 COX7CP15954 63 aa7.27□□□□□ -1.25
RHCE-208ENST00000527187 CSAG1Q6PB30 78 aa7.22□□□□□ -1.25
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.22□□□□□ -1.25
RHCE-208ENST00000527187 LCA10Q71F78 164 aa7.21□□□□□ -1.25
RHCE-208ENST00000527187 A8MUN3 132 aa7.2□□□□□ -1.26
RHCE-208ENST00000527187 KLKP1Q107X0 134 aa7.18□□□□□ -1.26
RHCE-208ENST00000527187 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.18□□□□□ -1.26
RHCE-208ENST00000527187 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.18□□□□□ -1.26
RHCE-208ENST00000527187 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.15□□□□□ -1.27
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.13□□□□□ -1.27
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RHCE-208ENST00000527187 LCE2BO14633 110 aa7.11□□□□□ -1.27
RHCE-208ENST00000527187 USH2AO75445 5202 aa7.1□□□□□ -1.27
RHCE-208ENST00000527187 SERP2Q8N6R1 65 aa7.1□□□□□ -1.27
RHCE-208ENST00000527187 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.1□□□□□ -1.27
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.09□□□□□ -1.28
RHCE-208ENST00000527187 NDUFC1O43677 76 aa7.09□□□□□ -1.28
RHCE-208ENST00000527187 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.07□□□□□ -1.28
RHCE-208ENST00000527187 DMAC1Q96GE9 116 aa7.03□□□□□ -1.28
RHCE-208ENST00000527187 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RHCE-208ENST00000527187 H0YAA0 97 aa7□□□□□ -1.29
RHCE-208ENST00000527187 PMAIP1Q13794 54 aa6.97□□□□□ -1.29
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.96□□□□□ -1.3
RHCE-208ENST00000527187 SSPOA2VEC9 5147 aa6.96□□□□□ -1.3
RHCE-208ENST00000527187 CRIPTQ9P021 101 aa6.95□□□□□ -1.3
RHCE-208ENST00000527187 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.93□□□□□ -1.3
RHCE-208ENST00000527187 ACYP2P14621 99 aa6.93□□□□□ -1.3
RHCE-208ENST00000527187 SNURFQ9Y675 71 aa6.92□□□□□ -1.3
RHCE-208ENST00000527187 C20orf197Q8N268 126 aa6.9□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 BRK1Q8WUW1 75 aa6.9□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.9□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.88□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.88□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.84□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.84□□□□□ -1.31
RHCE-208ENST00000527187 H7BZZ5 65 aa6.83□□□□□ -1.32
RHCE-208ENST00000527187 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.83□□□□□ -1.32
RHCE-208ENST00000527187 Q5VV11 94 aa6.82□□□□□ -1.32
RHCE-208ENST00000527187 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.77□□□□□ -1.33
RHCE-208ENST00000527187 MT1BP07438 61 aa6.77□□□□□ -1.33
RHCE-208ENST00000527187 P0C880 135 aa6.71□□□□□ -1.34
RHCE-208ENST00000527187 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.71□□□□□ -1.34
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.71□□□□□ -1.34
RHCE-208ENST00000527187 R4GN34 69 aa6.69□□□□□ -1.34
RHCE-208ENST00000527187 Q1T7F1 81 aa6.68□□□□□ -1.34
RHCE-208ENST00000527187 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RHCE-208ENST00000527187 A6NN06 94 aa6.63□□□□□ -1.35
RHCE-208ENST00000527187 M0QZ58 72 aa6.62□□□□□ -1.35
RHCE-208ENST00000527187 COA5Q86WW8 74 aa6.62□□□□□ -1.35
RHCE-208ENST00000527187 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP10-5P60370 271 aa6.6□□□□□ -1.35
RHCE-208ENST00000527187 PLAC4Q8WY50 150 aa6.55□□□□□ -1.36
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.54□□□□□ -1.36
RHCE-208ENST00000527187 H3BS24 57 aa6.51□□□□□ -1.37
RHCE-208ENST00000527187 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.49□□□□□ -1.37
RHCE-208ENST00000527187 LINC01554Q52M75 96 aa6.48□□□□□ -1.37
RHCE-208ENST00000527187 MT1XP80297 61 aa6.41□□□□□ -1.38
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.34□□□□□ -1.39
RHCE-208ENST00000527187 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.34□□□□□ -1.39
RHCE-208ENST00000527187 PSPHP1O15172 72 aa6.33□□□□□ -1.4
RHCE-208ENST00000527187 A0A1B0GU33 70 aa6.31□□□□□ -1.4
RHCE-208ENST00000527187 A0A1B0GU69 56 aa6.3□□□□□ -1.4
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP12-2P59991 146 aa6.27□□□□□ -1.41
RHCE-208ENST00000527187 NEBP20929 6669 aa6.22□□□□□ -1.41
RHCE-208ENST00000527187 A6NED7 52 aa6.21□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.21□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.21□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 PRR15LQ9BU68 103 aa6.21□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP5-9P26371 169 aa6.2□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.18□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.17□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 A0A0D9SG42 100 aa6.16□□□□□ -1.42
RHCE-208ENST00000527187 A8MU10 97 aa6.15□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.12□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP10-12P60413 245 aa6.12□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 KMT2DO14686 5537 aa6.11□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP12-1P59990 96 aa6.09□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.09□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.09□□□□□ -1.43
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.02□□□□□ -1.45
RHCE-208ENST00000527187 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.02□□□□□ -1.45
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.02□□□□□ -1.45
RHCE-208ENST00000527187 UQCR11O14957 56 aa6□□□□□ -1.45
RHCE-208ENST00000527187 MDN1Q9NU22 5596 aa5.97□□□□□ -1.45
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.95□□□□□ -1.46
RHCE-208ENST00000527187 SPRR2EP22531 72 aa5.95□□□□□ -1.46
RHCE-208ENST00000527187 SPRR2BP35325 72 aa5.95□□□□□ -1.46
RHCE-208ENST00000527187 SPRR2AP35326 72 aa5.95□□□□□ -1.46
RHCE-208ENST00000527187 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.95□□□□□ -1.46
RHCE-208ENST00000527187 PRAC1Q96KF2 57 aa5.94□□□□□ -1.46
RHCE-208ENST00000527187 A0A0A0MQY5 61 aa5.9□□□□□ -1.47
RHCE-208ENST00000527187 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.86□□□□□ -1.47
RHCE-208ENST00000527187 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.84□□□□□ -1.47
RHCE-208ENST00000527187 ROMO1P60602 79 aa5.82□□□□□ -1.48
RHCE-208ENST00000527187 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms