RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 J3QR89 54 aa6.63□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.61□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 A0A087WVE0 104 aa6.6□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 KLKP1Q107X0 134 aa6.6□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.6□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.59□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 CSAG1Q6PB30 78 aa6.59□□□□□ -1.35
TNS1-216ENST00000480665 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.58□□□□□ -1.36
TNS1-216ENST00000480665 LINC00643Q86TS7 51 aa6.54□□□□□ -1.36
TNS1-216ENST00000480665 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-216ENST00000480665 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-216ENST00000480665 UQCRQO14949 82 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-216ENST00000480665 H0Y9P7 68 aa6.42□□□□□ -1.38
TNS1-216ENST00000480665 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.41□□□□□ -1.38
TNS1-216ENST00000480665 MT1XP80297 61 aa6.4□□□□□ -1.38
TNS1-216ENST00000480665 CRIPTQ9P021 101 aa6.4□□□□□ -1.38
TNS1-216ENST00000480665 ATOX1O00244 68 aa6.38□□□□□ -1.39
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.35□□□□□ -1.39
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.35□□□□□ -1.39
TNS1-216ENST00000480665 H0YAA0 97 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-216ENST00000480665 LINC00208Q96KT6 92 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-216ENST00000480665 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-216ENST00000480665 SCGB1A1P11684 91 aa6.33□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 OCR1Q9BZK8 76 aa6.33□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 IMUPQ9GZP8 106 aa6.33□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 MP68P56378 58 aa6.32□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 SPRR2EP22531 72 aa6.3□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 SPRR2BP35325 72 aa6.3□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 SPRR2AP35326 72 aa6.3□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 MT-ATP8P03928 68 aa6.28□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.28□□□□□ -1.4
TNS1-216ENST00000480665 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.25□□□□□ -1.41
TNS1-216ENST00000480665 PCP4P48539 62 aa6.23□□□□□ -1.41
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.22□□□□□ -1.41
TNS1-216ENST00000480665 A8MUN3 132 aa6.22□□□□□ -1.41
TNS1-216ENST00000480665 NDUFC1O43677 76 aa6.22□□□□□ -1.41
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP12-2P59991 146 aa6.22□□□□□ -1.41
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.22□□□□□ -1.41
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.21□□□□□ -1.42
TNS1-216ENST00000480665 H3BPC8 53 aa6.2□□□□□ -1.42
TNS1-216ENST00000480665 P0C880 135 aa6.18□□□□□ -1.42
TNS1-216ENST00000480665 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.17□□□□□ -1.42
TNS1-216ENST00000480665 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.14□□□□□ -1.43
TNS1-216ENST00000480665 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.14□□□□□ -1.43
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.13□□□□□ -1.43
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.13□□□□□ -1.43
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.12□□□□□ -1.43
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TNS1-216ENST00000480665 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.1□□□□□ -1.43
TNS1-216ENST00000480665 SPRR2DP22532 72 aa6.08□□□□□ -1.44
TNS1-216ENST00000480665 PLAC4Q8WY50 150 aa6.08□□□□□ -1.44
TNS1-216ENST00000480665 DMAC1Q96GE9 116 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP10-12P60413 245 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-216ENST00000480665 SNURFQ9Y675 71 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-216ENST00000480665 R4GN34 69 aa6.03□□□□□ -1.44
TNS1-216ENST00000480665 M0QZ58 72 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-216ENST00000480665 SERP2Q8N6R1 65 aa5.99□□□□□ -1.45
TNS1-216ENST00000480665 ACYP2P14621 99 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-216ENST00000480665 C20orf197Q8N268 126 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-216ENST00000480665 LCE3BQ5TA77 95 aa5.96□□□□□ -1.46
TNS1-216ENST00000480665 COX7CP15954 63 aa5.95□□□□□ -1.46
TNS1-216ENST00000480665 LINC01554Q52M75 96 aa5.93□□□□□ -1.46
TNS1-216ENST00000480665 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-216ENST00000480665 CCDC179H3BU77 68 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-216ENST00000480665 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.88□□□□□ -1.47
TNS1-216ENST00000480665 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-216ENST00000480665 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TNS1-216ENST00000480665 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.8□□□□□ -1.48
TNS1-216ENST00000480665 TMEM258P61165 79 aa5.77□□□□□ -1.49
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.75□□□□□ -1.49
TNS1-216ENST00000480665 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.74□□□□□ -1.49
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.73□□□□□ -1.49
TNS1-216ENST00000480665 COA5Q86WW8 74 aa5.73□□□□□ -1.49
TNS1-216ENST00000480665 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.72□□□□□ -1.49
TNS1-216ENST00000480665 H7BZZ5 65 aa5.71□□□□□ -1.5
TNS1-216ENST00000480665 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TNS1-216ENST00000480665 MT1EP04732 61 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.66□□□□□ -1.5
TNS1-216ENST00000480665 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.62□□□□□ -1.51
TNS1-216ENST00000480665 SEC61GP60059 68 aa5.6□□□□□ -1.51
TNS1-216ENST00000480665 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.59□□□□□ -1.51
TNS1-216ENST00000480665 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.51□□□□□ -1.53
TNS1-216ENST00000480665 LCE1DQ5T752 114 aa5.51□□□□□ -1.53
TNS1-216ENST00000480665 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.47□□□□□ -1.53
TNS1-216ENST00000480665 A0A1B0GU33 70 aa5.47□□□□□ -1.53
TNS1-216ENST00000480665 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.47□□□□□ -1.53
TNS1-216ENST00000480665 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.47□□□□□ -1.53
TNS1-216ENST00000480665 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.46□□□□□ -1.54
TNS1-216ENST00000480665 A0A0D9SG42 100 aa5.45□□□□□ -1.54
TNS1-216ENST00000480665 A0A1B0GU69 56 aa5.45□□□□□ -1.54
TNS1-216ENST00000480665 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.43□□□□□ -1.54
TNS1-216ENST00000480665 MT1GP13640 62 aa5.41□□□□□ -1.54
TNS1-216ENST00000480665 MT1MQ8N339 61 aa5.4□□□□□ -1.54
TNS1-216ENST00000480665 MT1LQ93083 61 aa5.38□□□□□ -1.55
TNS1-216ENST00000480665 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.37□□□□□ -1.55
TNS1-216ENST00000480665 V9GYY9 64 aa5.37□□□□□ -1.55
TNS1-216ENST00000480665 MT4P47944 62 aa5.36□□□□□ -1.55
TNS1-216ENST00000480665 LCE4AQ5TA78 99 aa5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms